diff --git a/imgs/coverage.svg b/imgs/coverage.svg
index 6a91c8d4..ea71b13a 100644
--- a/imgs/coverage.svg
+++ b/imgs/coverage.svg
@@ -17,7 +17,7 @@
         <text x="32.5" y="14">coverage</text>
     </g>
     <g fill="#fff" text-anchor="middle" font-family="DejaVu Sans,Verdana,Geneva,sans-serif" font-size="11">
-        <text x="83.0" y="15" fill="#010101" fill-opacity=".3">91%</text>
-        <text x="82.0" y="14">91%</text>
+        <text x="83.0" y="15" fill="#010101" fill-opacity=".3">90%</text>
+        <text x="82.0" y="14">90%</text>
     </g>
 </svg>
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz
index 20910988..932ce15a 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz.tbi b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz.tbi
index 0020edfb..20ea4f71 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz.tbi and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.base.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz
index dcd1ee98..1155c4eb 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz.tbi b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz.tbi
index c7864db6..99e7d39f 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz.tbi and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine.comp.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz
index e13f1547..03fccf52 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz.tbi b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz.tbi
index 7745277c..a9bb8f7e 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz.tbi and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.base.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz
index 0f681f86..f08b3c1a 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz.tbi b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz.tbi
index 39c0bb3b..a55580c5 100644
Binary files a/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz.tbi and b/repo_utils/answer_key/ga4gh/ga4gh_withrefine_orig.comp.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/repo_utils/answer_key/help.txt b/repo_utils/answer_key/help.txt
index 68d54c1c..0fdc9aed 100644
--- a/repo_utils/answer_key/help.txt
+++ b/repo_utils/answer_key/help.txt
@@ -1,6 +1,6 @@
 usage: truvari [-h] CMD ...
 
-Truvari v5.1.0 Structural Variant Benchmarking and Annotation
+Truvari v5.1.1 Structural Variant Benchmarking and Annotation
 
 Available commands:
     bench         Performance metrics from comparison of two VCFs
diff --git a/repo_utils/test_files/external/fake_mafft/lookup/fm_03ffe346bf2196b0ceebee5beb9a6acb.msa b/repo_utils/test_files/external/fake_mafft/lookup/fm_03ffe346bf2196b0ceebee5beb9a6acb.msa
new file mode 100644
index 00000000..c6e4fe54
--- /dev/null
+++ b/repo_utils/test_files/external/fake_mafft/lookup/fm_03ffe346bf2196b0ceebee5beb9a6acb.msa
@@ -0,0 +1,4200 @@
+>HG002_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG002_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG005_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG005_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatgcatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00096_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00096_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00171_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00171_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00438_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatata-------ttatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00438_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00512_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00512_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatatattattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00513_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00513_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00514_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00514_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00621_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00621_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00673_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00673_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatata-------ttatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00731_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00731_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00732_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00732_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00733_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00733_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00735_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG00735_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatataatatataattgtatattatatattatata-atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattttatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatata
+tatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatata
+attatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG00741_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00741_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG00864_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattatata
+taattatatataattatatataatataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattat---
+-------------------------------atatatattaatatataattgtatatata
+attatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG00864_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01071_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01071_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01106_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01106_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01109_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01109_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+atta-tatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01114_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01114_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+attatatattaatatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatat--tatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01123_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01123_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01175_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01175_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01243_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01243_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01258_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01258_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+---------taatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataat----------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtggagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01358_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataat----------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtggagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01358_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01361_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01361_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01505_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01505_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01596_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01596_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01891_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01891_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01928_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01928_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01952_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG01952_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01978_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG01978_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatataattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtggagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02011_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02011_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02055_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataattatattatatattatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02055_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataattatattatatattatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02080_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02080_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02109_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02109_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-at---------ta
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02145_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattatatataataaaattatatataattatatata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02145_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02148_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02148_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02257_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02257_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02486_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatataaaattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+----tatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02486_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatatat-------taatatataattatattatat
+-------attaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattata-
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+-----tat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02492_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatata--
+--atatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02492_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02559_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02559_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02572_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatat--tatatatt
+atatat--tatata-------ttatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02572_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02587_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02587_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02622_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02622_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+attattatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02630_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta--------------------------------------------------------
+-----------------------------------------atatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02630_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02717_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02717_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02723_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataat----------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02723_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatataaatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--tatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02818_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatatt-tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG02818_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02886_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG02886_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+-----tat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+----tatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03009_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03009_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaat-----------------------
+--atatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataatta----
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03065_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03065_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+atta-tatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03098_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+atta-tatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03098_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataat----------------------------------------
+---------------------------tatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaat-----------------------
+--atatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03125_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+atta-tatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03125_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatatatataatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatatattatata-taatatataattatattatat
+atta-tatataatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatat-aatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatg--------------------tatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattat-----------
+----------------atataattatatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatat-
+---tatat-ata-----------------------------------------atatatt
+atatatataatata-tatatattatataatatatataaattatatatat---tatatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tatatattatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatata--------ttat---
+---------------------------ataatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+------------------tatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03371_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03371_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03453_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03453_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03486_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03486_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03492_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03492_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03516_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03516_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03540_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03540_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03579_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataataatataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03579_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03683_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>HG03683_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatata------------
+---atatatataaatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03732_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--at--atataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>HG03732_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatat-attataatatataattatataatatataa
+ttata-tattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatatattatata-------ttatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--tatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA12329_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA12329_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+-----tat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA12878_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtggagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA12878_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA18534_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA18534_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA18906_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--ta---------tatatatt
+atatat--tatata-------ttatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA18906_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA18939_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA18939_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19238_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19238_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19239_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+attatatattaatatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatat--tatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19239_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19240_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19240_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19650_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatat-tatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19650_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgt-tatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19983_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA19983_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+attatatattaatatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatat--tatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA20129_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtataat
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA20129_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA20509_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattata-tatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataatatatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctc-gctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA20509_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA20847_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA20847_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataat--tatatataattaattataattaa
+ctatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------------
+-tatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>NA21309_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+attatatattaatatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatatattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatat--tatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatata-----------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA21309_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA24385_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>NA24385_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>PGP1_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattat-ttattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>PGP1_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:HG00733_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:HG00733_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:HG02818_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatatt-tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:HG02818_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+a--atataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaa
+tatataattgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>ei:HG03486_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattattt-attataatatataattatataatatataa
+ttata-ttatataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatattatatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatatataataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:HG03486_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:NA19240_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+atta-------atatataattatattatata-----------------------------
+-------------------------------ttatatattaatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataatatataattatataatatataa
+ttatattattataat-atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tat--tatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--------------------------------------tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ei:NA19240_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata----atatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatat--tatata-------atatataatatacataatttatatatat---tgtatatt
+atataatatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattatatataataaaattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>li:HG00733_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>li:HG00733_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------aaataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>li:NA12878_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>li:NA12878_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatatta---
+-----------atatataattatattatata-----------------------------
+--------ttaatatataattatattatatattatatat-aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaa------------------------
+---tatat-atatatataattatatat---------------------------tatata
+atatataatatataatatataatatataatatatataattataatatataattgtatatt
+atatattatata------------------------------atatataatatatataat
+tataatatataattgtatat----------------------tata-attatataatata
+taattataatatacaattatatattatataatatataattgtata--ttataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtatatatatta----------------------------------atatataat
+tgtatatataattatatatatattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataattatatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtggagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcacgccattctcctgcctc
+>li:NA24385_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>li:NA24385_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>syndip_1_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>syndip_2_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatataaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtatta
+tataattttatatatgtatatatatgtttatatatgtatatataattatatatgtattat
+aatgtattatataattgtataatataatatataataatataatatataattatttattat
+aatatataattatataatatataattatattattataat---------------------
+----------------atataat--tatatataattatatatataattaattataattaa
+ttatatttatatat--tatatataattatatgtaaatataat-tatatatattatatata
+atatata--ataaatataattatatatataatata-tattatatatatattatatatatt
+atatatattatatattatataatatataatatacataatttatatata-----gtatatt
+atataatatataatatataa---------------------tatatataatatatataat
+tataata-----------------------------------tata-attatatataata
+aaattat----------------------------------------atataattat---
+----------------------atataattatatat-attatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--t----------------------------------atatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
+>ref_chr1:600-1000
+ctcccagctaatttatatatataatatata--taatatataattatattatatattatat
+att---------------------------------------------------------
+----------------------------------------aatatataattatattatat
+attatatattaatatataatgtattatacatatataattatataaattatgtatgtat--
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+-------------------------------tatataattatatataatataattatata
+taattgtata--------------------------------------------------
+--------------------tattaatatataattgtatatataat--------------
+------------------------------------------------------------
+------------------------------------------------------------
+--tatatatatattaatatataattgtatatataat--tatatatattaatatataattg
+tatatataattatatatataatatatacatatatattttttcgagaaagagtctttctct
+gtcacccacgctggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaagctccacctcccagg
+ttcatgccattctcctgcctc
diff --git a/truvari/__init__.py b/truvari/__init__.py
index 1a9e3c5c..77121047 100644
--- a/truvari/__init__.py
+++ b/truvari/__init__.py
@@ -67,7 +67,7 @@
 :data:`truvari.SZBINTYPE`
 """
 
-__version__ = '5.1.0'
+__version__ = '5.1.1'
 
 
 from truvari.bench import (