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<!DOCTYPE HTML>
<html>
<head>
<title>Automate Cellulaire</title>
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</head>
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<!-- Header -->
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<div id="header">
<!-- Logo -->
<div id="logo">
<h1><a href="index.html">Automate Cellulaire</a></h1>
<p>Université de Rennes 1 - <a href="https://etudes.univ-rennes1.fr/master-biogeno"> Master 1 BIG </a> - UE PRJ<p>
<p>Promo 2016 </p>
</div>
<!-- Nav -->
<nav id="nav">
<ul>
<li class="current"><a href="index.html">Accueil</a></li>
<li>
<a href="Regle.html">Projet</a>
<ul>
<li><a href="Projet.html">Spécification des besoins</a></li>
<ul>
<li><a href="Projet.html">Le déplacement</a></li>
<li><a href="Energie.html">L'énergie</a></li>
<li><a href="Virus.html">Les virus</a></li>
<li><a href="Clonage.html">Le clonage</a></li>
</ul>
<li><a href="Regle.html">Les règles</a></li>
<li><a href="AC.html">Analyse et Conception</a></li>
<li><a href="Stat.html">Test statistiques</a></li>
</ul>
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<li><a href="">Tutoriel</a></li>
<li><a href="#aboutus">About us</a></li>
<li><a href="#Contact">Nous contacter</a></li>
</ul>
</nav>
</div>
</div>
<!-- Main -->
<div class="wrapper style2">
<div class="title">Tests Statistiques</div>
<div id="main" class="container">
<div class="row 150%">
<div class="4u 12u(mobile)">
<!-- Sidebar -->
<div id="sidebar">
<section class="box">
<header>
<h2>Test statistique</h2>
</header>
<p>En statistiques, un test d'hypothèse est une démarche consistant à rejeter ou à ne pas rejeter (rarement accepter) une hypothèse statistique, appelée hypothèse nulle, en fonction d'un jeu de données (échantillon). Il s’agit de statistique inférentielle : à partir de calculs réalisés sur des données observées, nous émettons des conclusions sur la population, en leur rattachant des risques de se tromper.</p>
<a href="https://fr.wikipedia.org/wiki/Test_(statistique)" class="button style1">Plus d'informations</a>
</section>
</div>
</div>
<div class="8u 12u(mobile) important(mobile)">
<!-- Content -->
<div id="content">
<article class="box post">
<p>Dans le cadre de ce projet, nous avons réalisés de deux types de sorties différents.</p>
<ol>
<li>Dans le premier fichier, l'univers est une matrice carrée de taille 30. La probabilité des cellules contenu dans l'univers était de 10%. La probabilité d'énergie au départ de 100%. La probabilité était de 0. Les données utilisées sont celles de la 150eme générations. L'univers ne se renouvelle pas en énergie</li>
<li>Dans le deuxième fichier, l'univers est aussi une matrice carrée de taille 30. La probabilité des cellules contenu dans l'univers était de 10%. La probabilité d'énergie au départ de 1%. La probabilité des virus était de 0. Les données utilisées sont celles de la 150eme générations. L'univers se renouvelle en énergie</li>
</ol>
<p>
Le clustering est une méthode très intéressante pour étudier la structure et le groupement de nos données. Il est généralement basé sur la similarité ou la distance entre les objets.
</p>
<p>
Dans notre cas, nous avons utilisés Le partitionnement en <a href="https://fr.wikipedia.org/wiki/K-moyennes">k-moyennes</a> qui est une méthode de partitionnement de données et un problème d'optimisation combinatoire. Ici le nombre de k a été fixé a 4.
Dans cette étude, la probabilité de déplacement de plusieurs centaines de cellules vont être mesurée.
</p>
<header class="style1">
<h2>Cluster sur le fichier 1</h2>
<br/>
<img src="images/cluster1.png" alt="Cluster sur le fichier 1">
</a>
</header>
<p>
Nos données possèdent une structure hiérarchique c’est-à-dire que nos groupes possèdent des sous-groupes mutuelles.
Ceci va être visualisé dans une structure appelé dendrogramme qui présente un chemin intuitif pour visualiser la structure hiérarchique.
</p>
<header class="style1">
<h2>ClusPlot sur le fichier 1</h2>
<br/>
<img src="images/cluster1g.png" alt="Cluster sur le fichier 1">
</a>
</header>
<p>Cette figure montre la classification de ces 4 clusters, les cellules sont regroupés en 4 clusters en fonction de leurs probabilité de déplacement. Ces données ont été obtenir à partir du package <a href="https://cran.r-project.org/web/packages/mclust/mclust.pdf">mclust</a>.</p>
<header class="style1">
<h2>Évolution des cellules sur 150 générations</h2>
<br/>
<img src="images/dcellule.png" alt="Évolution des cellules sur 150 générations">
<p>Distribution des cellules sur 150 générations sans renouvellement d'énergie dans l'univers </p>
</a>
</header>
<p>On remarque que les cellules évoluent différemment au cours du temps.</p>
<header class="style1">
<h2>Cluster sur le fichier 2</h2>
<br/>
<img src="images/cluster2.png" alt="Cluster sur le fichier 2"
</a>
</header>
<p>
Nos données possèdent une structure hiérarchique c’est-à-dire que nos groupes possèdent des sous-groupes mutuelles.
Ceci va être visualisé dans une structure appelé dendrogramme qui présente un chemin intuitif pour visualiser la structure hiérarchique.
</p>
<header class="style1">
<h2>Model-based clustering plots: classification sur le fichier 2</h2>
<br/>
<img src="images/cluster2g.png" alt="Model-based clustering plots: classification sur le fichier 2">
<p>Distribution des cellules par comparaison des probabibilités déplacement deux à deux</p>
</a>
</header>
<header class="style1">
<h2>Évolution des cellules sur 150 générations</h2>
<br/>
<img src="images/dcellule2.png" alt="Évolution des cellules sur 150 générations">
<p>Distribution des cellules sur 150 générations avec renouvellement d'énergie dans l'univers </p>
</a>
</header>
<p>On remarque que les cellules évoluent différemment au cours du temps. En fonction de l’énergie qui a été ajouté dans notre automate.</p>
</article>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- Highlights -->
<div class="wrapper style3">
<div class="title" id="aboutus">Bio-Informaticiens</div>
<div id="highlights" class="container">
<div class="row 150%">
<div class="4u 12u(mobile)">
<section class="highlight">
<a href="#" class="image featured"><img src="images/CL.jpg" alt="Clément Lancien" /></a>
<h3><a href="#">Clément LANCIEN</a></h3>
<p>
Étudiant en première année du master de Bio-informatique et Génomique à l'Université de Rennes 1
</p>
<ul class="actions">
<li><a href="Projet.html" class="button style1">Plus d'informations</a></li>
</ul>
</section>
</div>
<div class="4u 12u(mobile)">
<section class="highlight">
<a href="#" class="image featured"><img src="images/AK.png" alt="Ali KACHALO"/></a>
<h3><a href="#">Ali KACHALO</a></h3>
<p>
Étudiant en première année du master de Bio-informatique et Génomique à l'Université de Rennes 1
</p>
<ul class="actions">
<li><a href="#" class="button style1">Plus d'informations</a></li>
</ul>
</section>
</div>
<div class="4u 12u(mobile)">
<section class="highlight">
<a href="#" class="image featured"><img src="images/HC.jpg" alt="Hans CERIL" /></a>
<h3><a href="#">Hans CERIL</a></h3>
<p>
Étudiant en première année du master de Bio-informatique et Génomique à l'Université de Rennes 1
</p>
<ul class="actions">
<li><a href="#" class="button style1">Plus d'informations</a></li>
</ul>
</section>
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- Footer -->
<div id="footer-wrapper" class="wrapper">
<div class="title" id ="Contact">Nous contacter</div>
<div id="footer" class="container">
<header class="style1">
<h2></h2>
<p>
Vous recherchez des informations supplémentaires? Contactez nous !!
</p>
</header>
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<!-- Contact Form -->
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<div class="6u 12u(mobile)">
<!-- Contact -->
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<div class="row">
<div class="6u 12u(mobile)">
<section>
<h3 class="icon fa-home">Adresse</h3>
<p>
Université de Rennes 1<br/>
Rue de Thabor<br/>
35000 Rennes<br/>
FRANCE
</p>
</section>
</div>
<div class="6u 12u(mobile)">
<section>
<h3 class="icon fa-comment">Master</h3>
<p>
<a href="https://etudes.univ-rennes1.fr/master-biogeno">Master BIG - Rennes 1</a>
</p>
</section>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="6u 12u(mobile)">
<section>
<h3 class="icon fa-envelope">Email</h3>
<p> clement.lancien</p>
<p> kachalo.ali</p>
<p> ceril.hans</p>
<p>@univ-rennes1.fr</p>
</section>
</div>
<div class="6u 12u(mobile)">
<section>
<h3 class="icon fa-phone">Téléphone</h3>
<p>
Pas disponible pour le moment :)
</p>
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</div>
</div>
</section>
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</div>
<hr />
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