Skip to content

Latest commit

 

History

History
43 lines (26 loc) · 1.42 KB

notes-problems.md

File metadata and controls

43 lines (26 loc) · 1.42 KB
Raw

PROBLEMS

  • Effet de l'environnement pour les simulations sans effet de l'environnement

    • Variance expliquée seulement; valeurs ne font pas de sens (e.g. le R2 = 0.04 pour Compet, ainsi que la variation est de 0.45 et 0.55 pour seulement effet environnement)

  • Autocorrélation spatiale limitée

    • Données non corrélées ?
    • Modèle pas assez souple ? -- pourtant le R2adj d'une partition de variance avec RDA est entre 0.3 et 0.4 pour les modèles neutre et metapop (tel qu'attendu)

  • Effet de co-distribution est quasi inexistant pour le modèle de compétition

    • Peut être noyé dans les autres interactions qui sont inexistantes

  • Pratiquement tous les scénarios ont la même signature, sauf le species sorting

  • Compet

    • On ne parvient pas à trouver le signal des interactions sur la co-distribution, même si on utiliser seulement l'effet aléatoire

  • Neutral

    • effet d'environnement
    • effet de co-distribution for dans covariance, mais pas dans l'effet aléatoire

  • Sorting --> cas parfait

  • Metapo -->

TODO

Case study: simulations COMPET. Il y a une structure dans ces données que des variables latentes devraient parvenir à révéler. Ce n'est pas le cas en ce moment.

HYP -

  1. L'application du code HMSC est inappropriée

  2. Il n'y a pas assez de signal dans les données -- essayer avec un cas à 3 espèces ?

  3. Un autre package pourrait trouver du signal