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mime type on WSL #529

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sanbrock opened this issue Jan 24, 2025 · 2 comments
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mime type on WSL #529

sanbrock opened this issue Jan 24, 2025 · 2 comments

Comments

@sanbrock
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Collaborator

sanbrock commented Jan 24, 2025

On windows under WSL, nomad parse <xxx>.nxs returns an error that no parser is taking this file, although pynxtools is installed and the nexus parser is registered in NOMAD.

@sanbrock
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Collaborator Author

Although python-magic 0.4.24 is installed on both platforms, on linux:

Python 3.11.9 (main, Apr 27 2024, 21:16:11) [GCC 13.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> a=b'\x89HDF\r\n\x1a\n\x00\x00\x00\x00\x00\x08\x08\x00\x04\x00\x10\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x18\xfb\x02\x00\x00\x00\x00\x00\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00`\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x88\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xa8\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\r\x00\x01\x00\x00\x00\x18\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x00\x10\x00\x00\x00\x00\x00\xe0\xb4\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xb0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00TREE\x00\x00\x01\x00\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xe0\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00'
>>> import magic
>>> magic.from_buffer(a,mime=True)
'application/x-hdf5'

but on WSL it returns 'application/x-hdf'

Solution is to change the mime-re for the nexus parser to 'application/x-hdf*'

@sanbrock
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Collaborator Author

fixed

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None yet
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant