Skip to content

Latest commit

 

History

History
263 lines (222 loc) · 36.1 KB

README.md

File metadata and controls

263 lines (222 loc) · 36.1 KB
Raw

😷️🇵🇹 Dados relativos à pandemia COVID-19 em Portugal

📅️ Última actualização: 28 de Junho de 2021, 16:14

ℹ️ Fonte dos dados: Direcção Geral de Saúde - Ministério da Saúde Português, através do dashboard do COVID-19 (aqui) e da base de dados da ESRI Portugal aqui, desde 03/03/2020.

👁️ Utilizaste estes dados para análises/plataformas/notícias?: Deixa-nos detalhes aqui, na categoria 🙌 Montra de Projectos.

✉️ Carta Aberta à Direcção Geral de Saúde: Escrevemos um relatório em formato de Carta Aberta que contém tudo o que aprendemos acerca da estratégia de dados da DGS a respeito do COVID-19. Nesta carta fazemos várias sugestões no sentido de criar uma verdadeira cultura de dados abertos no seio desta organização. Se fazes parte de uma organização que partilha estes valores, a carta pode ser assinada aqui

🤔 Contexto

Embora a comunicação e partilha de dados por parte do Ministério de Saúde Português tenha melhorado consideravelmente ao longo da crise do COVID-19, ainda está longe de ideal (havendo a destacar o exemplo do repositório da Protecção Civil Italiana no GitHub).

A informação disponibilizada pela Direcção Geral de Saúde (DGS), para além de não ter o nível de granularidade da das autoridades italianas, também não é disponibilizada em formatos abertos e facilmente inspeccionáveis/manipuláveis. Ficam assim dificultadas tarefas de análise, modelação e visualização por parte da comunidade (quer mais informal, quer mais académica/industrial) disposta a colaborar no combate à pandemia com as ferramentas que conhece: as de análise de dados.

❗ O compromisso deste repositório é justamente esse: todos os dias enquanto esta pandemia durar, o ficheiro data.csv será actualizado com a informação mais recente disponibilizada pela Direcção Geral de Saúde. Esta informação será extraída das fontes de dados da dashboard assim que disponbilizada (por vezes algumas horas depois do lançamento do relatório).

A estrutura base deste ficheiro, desenhada para fácil manipulação em Excel/Python/R não mudará, podendo a comunidade analítica considerá-lo um alvo imutável (em termos de localização e estrutura) para, por exemplo, alimentar plataformas de visualização/modelação. De notar que, mediante a evolução do formato dos relatórios de situação, poderão ser adicionadas novas colunas, mantendo-se claro a retrocompatibilidade. Fontes adicionais de dados poderão também ser adicionadas.

Porque tudo começa com bons dados.

👁️ Aplicações deste repositório

🧱 Estrutura

O repositório está organizado da seguinte forma:

  • data.csv: o Pastel de Nata. Dados extraídos da dashboard e do relatório diário da DGS.
  • amostras.csv: contém dados diários relativos às amostras, extraídos da dashboard da DGS.
  • vacinas.csv: contém dados diários relativos à vacinação, extraídos da dashboard da DGS. Nota: os valores de doses, tal como na dashboard e nas imagens publicadas nas redes sociais, correspondem apenas à população residente no continente, excluindo as ilhas. O mesmo se aplica nos relatórios de vacinação até 17-03-2021, com o relatório #6 de 24-03-2021 passando a incluir as ilhas. Adicionalmente, as vacinas unidose são contabilizadas como dose1 nos valores diários, embora sejam correctamente contabilizados e documentados como vacinação completa (doses2) no relatório semanal. Para ajustar os valores em falta para as ilhas e unidoses, os campos pessoas são ajustados com os valores semanais do relatório.
  • vacinas_detalhe.csv: contém dados detalhados semanais relativos à vacinação, extraídos do dataset do relatório de vacinação da DGS. Nota: até 17-03-2021 incluia apenas população residente no continente, vide nota de vacinas.csv. Nota: tal como todos os outros csv, a coluna data corresponde ao dia seguinte aos dados reportados (7 dias neste caso), enquanto o Relatório PDF refere o último dia desses 7 dias, e o Dataset CSV refere o primeiro dia desses 7 dias.
  • data_concelhos.csv: contém dados acumulados relativos aos confirmados por concelho, extraídos do dashboard da DGS (e por isso sujeito às mesmas limitações relativamente a abrangência e protecção de dados, nomeadamente concelhos com menos de 3 confirmados não são reportados). Esta série de dados tem início a 24-03-2020 e tem cadência diária até 04-07-2020, passando a cadência semanal a 14-07-2020, e terminando a 26-10-2020. Vide os próximos dados para o novo formato.
  • data_concelhos_14dias.csv e data_concelhos_incidencia.csv contém dados de confirmados do acumulado dos 14 dias anteriores à data do reporte, no primeiro ficheiro, e proporcional a 100k habitantes no segundo ficheiro. Inclui os dados calculados do data_concelhos.csv desde que os daddos são semanais, nomeadamente entre 27-07-2020 (correspondendo ao periodo de 13-07-2020 a 26-07-2020) até 26-10-2020, e será actualizado conforme seja disponibilizado pela DGS (semanalmente à segunda-feira).
  • archive/: arquivo de todos os relatórios de situação disponibilizados pela DGS, em formato .pdf. Os relatórios são disponibilizados diariamente, desde o dia 03-03-2020.
  • notebooks/: contém um notebook Python com um exemplo simples de como carregar e visualizar os dados.
  • extra/: contém fontes de dados extras que podem ser usadas para complementar as análises dos restantes dados. As descrições dessas fontes de dados encontram-se dentro de um README nessa pasta.

📡 API Rest para os dados portugueses e mundiais

Em conjunto com a VOST Portugal, desenvolvemos uma API disponível a todos com os dados disponibilizados deste repositório, numa tentativa de dar uma ferramenta mais acessível a todos os que querem analisar os dados. Podem aceder e consultar a documentação aqui: https://covid19-api.vost.pt

(Versão anterior, desatualizada) Autor: Carlos Matos | Grupo IFT

Dados em versão API com resposta JSON, atualização diária conforme esta base de dados e dados da OMS para o endpoint dos dados mundiais por país. Acesso via RapidApi, com exemplos de requisição e resposta, exemplos de clients e SDK.

📔 Dicionário dos dados

Uma explicação do conteúdo em data.csv.

📝 ARS: Administração Regional de Saúde

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data da publicação dos dados DD-MM-YYYY
data_dados Data e hora da recolha dos dados apresentados (quando omitida nos relatórios, assume-se como sendo a data da publicação dos dados). Geralmente, os dados são reportados até às 24h do dia anterior à data (equivalentes às 00h do dia de data, sendo este último o formato utilizado). DD-MM-YYYY HH:MM
confirmados Casos confirmados Inteiro >= 0
confirmados_arsnorte Casos confirmados na ARS Norte Inteiro >= 0
confirmados_arscentro Casos confirmados na ARS Centro Inteiro >= 0
confirmados_arslvt Casos confirmados na ARS Lisboa e Vale do Tejo Inteiro >= 0
confirmados_arsalentejo Casos confirmados na ARS Alentejo Inteiro >= 0
confirmados_arsalgarve Casos confirmados na ARS Algarve Inteiro >= 0
confirmados_acores Casos confirmados na Região Autónoma dos Açores Inteiro >= 0
confirmados_madeira Casos confirmados na Região Autónoma da Madeira Inteiro >= 0
confirmados_estrangeiro Casos confirmados no estrangeiro Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador. A partir de 28-03-2020, este indicador deixou de ser reportados e os respectivos casos imputados às ARS/Regiões de origem.
confirmados_novos Número de novos casos confirmados comparativamente ao dia anterior. É uma coluna calculada a partir da diferença nos casos confirmados entre dias consecutivos Inteiro >= 0
recuperados Total de casos recuperados Inteiro >= 0
obitos Total de óbitos Inteiro >= 0
internados Número de pacientes COVID-19 internados Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
internados_uci Número de pacientes COVID-19 internados em Unidades de Cuidados Intensivos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
lab Número de casos suspeitos a aguardar resultados laboratoriais Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
suspeitos Total de casos suspeitos (tendo a definição sido actualizada a 29/02/2020) desde 01/01/2020 Inteiro >= 0
vigilancia Número de casos sob vigilância pelas autoridades de saúde Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
n_confirmados Número de casos cuja suspeita de infecção não se confirmou Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
cadeias_transmissao Número de cadeias de transmissão do SARS-CoV-2 activas Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
transmissao_importada Número de casos confirmados com transmissão por via de infectados de outros países Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_0_9_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 0-9 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_0_9_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 0-9 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_10_19_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 10-19 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_10_19_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 10-19 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_20_29_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 20-29 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_20_29_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 20-29 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_30_39_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 30-39 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_30_39_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 30-39 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_40_49_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 40-49 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_40_49_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 40-49 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_50_59_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 50-59 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_50_59_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 50-59 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_60_69_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 60-69 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_60_69_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 60-69 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_70_79_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 70-79 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_70_79_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 70-79 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_80_plus_f Número de casos confirmados do sexo feminino na faixa etária 80+ anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_80_plus_m Número de casos confirmados do sexo masculino na faixa etária 80+ anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_tosse Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de tosse. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_febre Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de febre. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_dificuldade_respiratoria Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de dificuldades respiratórias. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_cefaleia Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de cefaleias. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_dores_musculares Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de dores musculares. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
sintomas_fraqueza_generalizada Percentagem de casos infetados que reportaram o sintoma de fraqueza generalizada. Conforme informa a DGS, estes dados são relativos apenas a uma %, não-especificada e variável, dos infectados fracção entre [0, 1] ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_f Número total de confirmados do sexo feminino Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em falta
confirmados_m Número total de confirmados do sexo masculino Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em falta
obitos_arsnorte Total de óbitos na ARS Norte Inteiro >= 0
obitos_arscentro Total de óbitos na ARS Centro Inteiro >= 0
obitos_arslvt Total de óbitos na ARS Lisboa e Vale do Tejo Inteiro >= 0
obitos_arsalentejo Total de óbitos na ARS Alentejo Inteiro >= 0
obitos_arsalgarve Total de óbitos na ARS Algarve Inteiro >= 0
obitos_acores Total de óbitos na Região Autónoma dos Açores Inteiro >= 0
obitos_madeira Total de óbitos na Região Autónoma da Madeira Inteiro >= 0
obitos_estrangeiro Total de óbitos no estrangeiro Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador. A partir de 28-03-2020, este indicador deixou de ser reportados e os respectivos casos imputados às ARS/Regiões de origem.
recuperados_arsnorte Total de pacientes recuperados na ARS Norte Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_arscentro Total de pacientes recuperados na ARS Centro Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_arslvt Total de pacientes recuperados na ARS Lisboa e Vale do Tejo Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_arsalentejo Total de pacientes recuperados na ARS Alentejo Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_arsalgarve Total de pacientes recuperados na ARS Algarve Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_acores Total de pacientes recuperados na Região Autónoma dos Açores Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_madeira Total de pacientes recuperados na Região Autónoma da Madeira Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
recuperados_estrangeiro Total de pacientes recuperados no estrangeiro Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador. A partir de 28-03-2020, este indicador deixou de ser reportados e os respectivos casos imputados às ARS/Regiões de origem.
obitos_0_9_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 0-9 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_0_9_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 0-9 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_10_19_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 10-19 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_10_19_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 10-19 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_20_29_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 20-29 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_20_29_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 20-29 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_30_39_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 30-39 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_30_39_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 30-39 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_40_49_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 40-49 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_40_49_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 40-49 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_50_59_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 50-59 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_50_59_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 50-59 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_60_69_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 60-69 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_60_69_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 60-69 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_70_79_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 70-79 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_70_79_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 70-79 anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_80_plus_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino na faixa etária 80+ anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_80_plus_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino na faixa etária 80+ anos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
obitos_f Número total de óbitos de pacientes do sexo feminino Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em falta
obitos_m Número total de óbitos de pacientes do sexo masculino Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em falta
confirmados_desconhecidos_m Número de casos confirmados do sexo masculino com idade desconhecida Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_desconhecidos_f Número de casos confirmados do sexo masculino com idade desconhecida Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
ativos Número de casos ativos Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
internados_enfermaria Número de pacientes COVID-19 internados em Enfermaria (não Unidades de Cuidados Intensivos) Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
confirmados_desconhecidos Número de casos confirmados com sexo desconhecido Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
incidencia_nacional Número de casos confirmados nos 14 dias anteriores e por 100 mil habitantes, nacional, desde 15-03-2021 Fração >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
incidencia_continente Número de casos confirmados nos 14 dias anteriores e por 100 mil habitantes, continente, excluindo ilhas, desde 15-03-2021 Fração >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
rt_nacional R(t) nacional, desde 15-03-2021 Fração >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador
rt_continente R(t) continente, excluindo ilhas, desde 15-03-2021 Fração >= 0 ou vazio para os dias em que a DGS não reportava este indicador

Definições exactas de alguns destes termos constam do glossário do Plano Nacional de Preparação e Resposta à Doença por novo coronavírus (COVID-19) (página 65 em diante). A 26/03/2020, a soma do número de pacientes recuperados por ARS/Região Autónoma nem sempre é igual ao número total de recuperados. A DGS reportou os dados desta forma, indicando que o diferencial correspondia a "21 casos recuperados laboratorialmente" e a "aguardar mais informação."

Uma outra métrica com potencial interesse científico, o número de casos com base na data de início de sintomas, é também reportada pela DGS. No entanto, é apenas disponibilizado um gráfico de eixos esparsos, o que pode introduzir erros de aproximação na transcrição e comprometer a factualidade dos dados. Por essa razão, esta informação é propositadamente excluída.

Relativamente ao conteúdo em amostras.csv:

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data a que se referem os dados DD-MM-YYYY
amostras Número total de amostras processadas Inteiro >= 0 ou vazio
amostras_novas Número diário de novas amostras processadas Inteiro >= 0 ou vazio
amostras_pcr Número total de amostras PCR processadas Inteiro >= 0 ou vazio
amostras_pcr_novas Número diário de novas amostras PCR processadas Inteiro >= 0 ou vazio
amostras_antigenio Número total de amostras Antigénio processadas Inteiro >= 0 ou vazio
amostras_antigenio_novas Número diário de novas amostras Antigénio processadas Inteiro >= 0 ou vazio

Relativamente a estes dados, o dashboard da DGS dá conta de que "correspondem ao número de amostras processadas para diagnóstico de SARS-CoV-2 em laboratórios públicos e privados desde o dia 1 de março." Dizem ainda que "Os dados diários após 2 de abril de 2020 ainda estão a ser recolhidos, pelo que os valores no gráfico poderão sofrer alterações." De facto, há a possibilidade de, a cada dia, dados referentes a dias anteriores serem alterados, provavelmente pelo facto de a informação relativa ao processamento de amostras ser recebida pela DGS com alguns dias de desfasamento.

Relativamente ao conteúdo em vacinas.csv:

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data a que se referem os dados DD-MM-YYYY
doses Número total de doses de vacinas administradas em Portugal continental Inteiro >= 0 ou vazio
doses_novas Número diário de doses de vacinas administradas em Portugal continental Inteiro >= 0 ou vazio
doses1 Número total de primeiras doses de vacinas administradas em Portugal continental. Nota: inclui unidoses Inteiro >= 0 ou vazio
doses1_novas Número diário de primeiras doses de vacinas administradas em Portugal continental. Nota: inclui unidoses Inteiro >= 0 ou vazio
doses2 Número total de segundas doses de vacinas administradas em Portugal continental. Nota: exclui unidoses Inteiro >= 0 ou vazio
doses2_novas Número diário de segundas doses de vacinas administradas em Portugal continental. Nota: exclui unidoses Inteiro >= 0 ou vazio
pessoas_vacinadas_completamente Número total de pessoas com vacinação completa - com vacina unidose ou com ambas as doses - em Portugal incluindo as ilhas. Tenderá para o total da população. É ajustado semanalmente com os valores do relatório para a diferença de unidose e ilhas Inteiro >= 0 ou vazio
pessoas_vacinadas_completamente_novas Número diário de pessoas com vacinaçao completa Inteiro >= 0 ou vazio
pessoas_vacinadas_parcialmente Número total de pessoas com vacinaçao parcial - com apenas a primeira dose de vacinas com duas doses. Tenderá para zero conforme a população receba a segunda dose. É ajustado semanalmente como o completamente Inteiro >= 0 ou vazio
pessoas_vacinadas_parcialmente_novas Número diário de pessoas com vacinaçao parcial. Poderá ser negativo em dias que sejam administradas mais segundas doses que primeiras. Inteiro >= 0 ou vazio
vacinas Número total de doses de vacina. Equivalente ao doses mas ajustado semanalmente com os valores das ilhas. Inteiro >= 0 ou vazio
vacinas_novas Número diário de novas doses de vacinas. Inteiro >= 0 ou vazio

Relativamente ao conteúdo em vacinas_detalhe.csv:

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data a que se referem os dados DD-MM-YYYY
recebidas Número total de doses de vacinas recebidas Inteiro >= 0 ou vazio
distribuidas Número total de doses de vacinas distribuidas Inteiro >= 0 ou vazio
[*] As colunas seguintes referem-se aos valores para Portugal continental, sem sufixo, e repetindo depois com cada sufixo por idade [0_17, 18_24, 25_49, 50_64, 65_79, 80+, desconhecido], e por ARS [arsnorte, arscentro, arslvt, arsalentejo, arsalgarve, madeira, açores, outro]
doses Número total de doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses_novas Número diário de doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses1 Número total de primeiras doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses1_novas Número diário de primeiras doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses2 Número total de segundas doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses2_novas Número diário de segundas doses de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
dosesunk Número total de doses desconhecidas de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
dosesunk_novas Número diário de doses desconhecidas de vacinas administradas Inteiro >= 0 ou vazio
doses1_perc Percentagem de população vacinada com a primeira dose fracção entre [0, 1] ou vazio
doses2_perc Percentagem de população vacinada com a segunda dose fracção entre [0, 1] ou vazio
populacao1 População a que se referem os dados (doses1 ÷ doses1_perc), a que deverá corresponder ao respectivo valor de população de acordo com INE/PORDATA 2019 Inteiro >= 0 ou vazio
populacao2 População a que se referem os dados (doses2 ÷ doses2_perc), a que deverá corresponder ao respectivo valor de população de acordo com INE/PORDATA 2019 Inteiro >= 0 ou vazio

Relativamente ao ficheiro data_concelhos.csv:

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data a que se referem os dados DD-MM-YYYY
[nome_concelho] Número total de casos acumulados Inteiro >= 0 ou vazio para os dias em que este indicador não é reportado neste concelho caso seja inferior a 3.

Estes dados são extraídos do serviço da ESRI de ArcGIS e podem ter algumas diferenças em relação ao boletim oficial (isto é, concelhos que deixam de aparecer no boletim continuam a aparecer no serviço). A partir de 31/03, estes casos passaram a ser reportados pelas Administrações Regionais de Saúde e Regiões Autónomas, sendo que qualquer conclusão com base nos dias anteriores deve ser tomada com cuidado.

Relativamente ao ficheiro rt.csv:

Nome da coluna Significado Possíveis valores
data Data a que se referem os dados DD-MM-YYYY
rt_[região] Rt para a respectiva região Fração >= 0 ou vazio
rt_95_inferior_[região] Limite inferior Índice Confiança 95% do Rt para a respectiva região Fração >= 0 ou vazio
rt_95_superior_[região] Limite superior Índice Confiança 95% do Rt para a respectiva região Fração >= 0 ou vazio

Estes dados são extraídos do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA)

💡 Problemas, inconsistências e melhorias

Quaisquer sugestões de dados complementares (provenientes de fontes oficiais), inconsistências nos dados ou melhorias genéricas, à vontade ➡️ Issues ou Pull Requests.

🌍 Sobre a Data Science for Social Good Portugal

A Data Science for Social Good Portugal é uma comunidade aberta de cientistas de dados, amantes de dados e entusiastas de dados que querem atacar problemas que importam verdadeiramente. Acreditamos no poder dos dados para transformar a nossa sociedade para o melhor e para todos.

@dssgPT | fb.com/DSSGPortugal | Instagram @dssg_pt | LinkedIn