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Custom brain region root Isocortex Olfactory areas Hippocampal formation Ammon's horn Dentate gyrus, molecular layer Dentate gyrus, polymorph layer Dentate gyrus, granule cell layer Fasciola cinerea Induseum griseum Entorhinal area Parasubiculum Postsubiculum Presubiculum Subiculum Cortical subplate Claustrum Endopiriform nucleus Lateral amygdalar nucleus Basolateral amygdalar nucleus Basomedial amygdalar nucleus Posterior amygdalar nucleus Striatum Caudoputamen Nucleus accumbens Fundus of striatum Olfactory tubercle Lateral septal complex Striatum-like amygdalar nuclei Pallidum Thalamus Ventral group of the dorsal thalamus Subparafascicular nucleus Subparafascicular area Peripeduncular nucleus Geniculate group, dorsal thalamus Lateral group of the dorsal thalamus Anterior group of the dorsal thalamus Medial group of the dorsal thalamus Midline group of the dorsal thalamus Intralaminar nuclei of the dorsal thalamus Reticular nucleus of the thalamus Geniculate group, ventral thalamus Epithalamus Hypothalamus Midbrain Midbrain, sensory related Midbrain, motor related Midbrain, behavioral state related Pons Pons, sensory related Pons, motor related Pons, behavioral state related Medulla Medulla, sensory related Medulla, motor related Medulla, behavioral state related Cerebellum Cerebellar cortex Cerebellar nuclei fiber tracts ventricular systems
RGB colour 0;0;0 143;0;142 101;45;66 129;47;180 129;47;180 129;47;180 129;47;180 153;87;194 129;47;180 129;47;180 205;71;218 141;42;150 183;55;195 166;70;184 176;61;187 117;37;120 117;37;120 95;17;98 111;20;114 98;24;99 123;21;126 104;19;108 103;41;6 103;41;6 127;50;7 127;50;7 127;50;7 111;52;18 127;63;29 122;102;51 0;143;127 0;127;123 0;127;123 0;127;123 0;127;123 0;127;123 0;111;96 0;111;96 0;111;96 0;111;96 0;111;96 0;111;96 0;111;96 0;111;96 25;187;199 0;155;0 0;133;0 0;111;0 0;111;0 0;100;119 0;81;144 0;69;121 0;60;106 0;100;50 0;90;45 0;76;38 0;57;29 15;15;127 15;15;127 15;15;127 51;51;51 85;85;85
Atlas Ids 997 315 698 1089 375 10703 10704 632 982 19 909 843 1037 1084 502 703 583 942 131 295 319 780 477 672 56 998 754 275 278 803 549 637 406 609 1044 1008 138 239 444 571 51 262 1014 958 1097 313 339 323 348 771 1132 987 1117 354 386 370 379 512 528 519 1009 73
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