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Mise à jour et standardisation des séries chronologiques d'abondance du saumon atlantique sur les cours d'eau de l'ORE DiaPFC

Estimer la taille des populations de saumon atlantique (Salmo salar) et leurs incertitudes associées et ce, à différents stades de vie, est crucial pour étudier leurs dynamiques et proposer des stratégies raisonnables de gestion aussi bien au niveau local qu’international. Les séries chronologiques d’abondance du saumon atlantique en France, collectées sur les cours d’eau de l’Observatoire de Recherche en Environnement sur les Poissons Diadromes dans les Petits Fleuves Côtiers (ORE DiaPFC), constituent le support observationnel sur lequel se fonde le système de régulation de l’exploitation du saumon sur le bassin de l’Adour – Nivelle, en Bretagne et en Basse-Normandie. Au niveau international, les rivières de l’ORE DiaPFC contribuent au réseau des rivières « index » dont les séries temporelles sont utilisées par le groupe de travail sur le saumon de l’Atlantique Nord du Conseil International pour l’Exploration de la Mer (CIEM) et qui servent à évaluer le statut annuel de l’espèce au travers de toute son aire de distribution. Au cours des trois dernières décennies, des méthodes obsolètes et très hétérogènes ont été utilisées pour produire les séries d’abondance de l’ORE DiaPFC.

Les objectifs liés à cette fiche action étaient donc de pallier à cette déficience en modernisant et standardisant les méthodes servant à produire les séries d’abondance sur tous les petits fleuves côtiers de l’ORE DiaPFC (la Nivelle, l’Oir, le Scorff, la Bresle) et ce, à tous les stades de vie faisant l’objet de suivi, i.e. adulte anadrome, juvénile en eau douce (ou tacon), juvénile migrant (ou smolt). Des modèles hiérarchiques ont ainsi été développés à des fins d’estimation dans un cadre bayésien. Ces modèles facilitent l'intégration de sources de données multiples et associées à différentes échelles (spatiales ou temporelles). Ils permettent également de transférer de l’information entre les années riches en données vers les années pauvres en données. Le présent rapport décrit les traits communs de la modélisation pour chaque stade de vie ainsi que les spécificités propres à chaque site. Il illustre également les principaux résultats obtenus en matière d’estimation des séries d’abondance mais aussi des paramètres des modèles permettant de produire ces estimations. Conformément à ces objectifs initiaux, le travail réalisé permet, d’une part, de faciliter l’incrémentation annuelle des séries d’abondance de l’ORE DiaPFC et, d’autre part, de produire des séries temporelles révisées. Ces dernières sont sans équivalent pour l'étude de la dynamique des populations de saumon, en particulier pour l'analyse des relations stock-recrutement. Il s’agit d’un préalable indispensable dans la perspective d’une refondation du système de régulation de l’exploitation du saumon en France.