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Revision de Columnas del Query #1

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Helysalgado opened this issue Mar 2, 2022 · 0 comments
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Revision de Columnas del Query #1

Helysalgado opened this issue Mar 2, 2022 · 0 comments

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@Helysalgado
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Collaborator

Dudas de algunas columnas de la tabla de resultados del query

@luizjoze

  • DistanceSiteToPm es igual al Center Position, porque Center Position es una posición relativa del sitio al promotor. Hay que quitarla porque es redundante, ademas de que siempre asignan null en los 3 subqueries.
  • DistanceSiteToGene -- esta columna si esta calculada en la tabla de regulatory interaction, pero asignan null en los 3 subqueries
  • TUFirstGeneName- para 2 subconsultas se proyecta el primer gene de la tu, pero para el subquery tf-gene, se proyecta el gene regulado, que ya esta en la columna de genes ... sugiero dejarlo vacio para este subquery tf-gene, porque en realidad es el primer gene de la TU.
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