-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
T1T2_snps_denovo_v2.list
5520 lines (5520 loc) · 37.5 KB
/
T1T2_snps_denovo_v2.list
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
849
938
2212
5224
5353
7124
7178
7304
8460
8604
8642
9361
11597
14022
14089
14217
15176
17526
19543
20488
20537
20584
21638
21649
21665
21883
21902
21959
22016
22086
22194
22330
22671
22720
22907
23044
23378
23929
24017
24342
24600
24649
24856
25059
25201
25215
25298
25456
25482
25525
25579
25591
25666
25680
25786
25792
25807
25885
25942
25954
25957
25987
25991
26005
26029
26050
26069
26113
26137
26247
26402
26701
27188
27194
27207
27340
27656
27824
27857
27859
27860
27862
28274
28453
28479
29010
29398
29801
29807
29853
30381
30424
30572
30874
31374
31412
31495
32087
32243
32597
32606
32730
32832
33247
33294
33424
33553
33576
33646
34133
34335
34536
35007
35115
35459
35520
35608
35633
35699
35714
35725
36446
36610
36612
37210
37266
37658
37750
38418
38797
39565
39812
40382
40655
40739
40786
40788
41046
41091
41254
41528
41542
41739
41803
42284
42313
42444
42471
42514
42560
42721
42810
42861
42925
42972
43009
43084
43214
43305
43659
43714
43768
44015
44034
44186
44206
44219
44405
44492
44670
44918
45182
45440
45864
45926
46127
46248
46312
46562
46907
47216
47228
47802
47912
48003
48022
48095
48384
48684
48719
48852
48967
49621
49681
49733
49748
49804
49907
50182
50226
50330
50476
50774
50822
51182
51231
51260
51353
51388
51402
51458
51531
51939
52079
52203
52568
52674
52677
52830
53237
53367
53922
53969
55047
55066
55099
55100
55102
55469
55474
55475
55486
55489
55493
55496
55497
55509
55513
55515
55519
55527
56673
56682
56693
56694
56695
56700
56703
56708
56709
56711
56718
56730
56742
56756
56834
56842
56853
56854
56855
56864
56865
56923
56928
56929
56930
56936
56946
56949
56950
56951
56952
56967
57092
57156
59087
59094
59103
59117
59391
59430
59456
59499
59562
60294
61386
61427
61452
61577
61931
61957
62057
62178
62559
62605
62939
63100
63170
63306
63467
63530
63637
63681
63982
64177
64282
64468
64502
64509
64528
64642
64701
65206
65211
65365
65845
66011
66093
66182
66255
66424
66764
66977
67051
67274
67340
67369
67396
67408
67549
67608
67657
68276
68326
68381
68399
68453
68479
68520
68528
68596
68659
68662
68688
68863
69037
69223
69334
69526
69823
70044
70186
70205
70334
70338
70508
71100
71307
71459
71775
71907
72210
72311
72510
72809
73088
73416
73492
74009
74069
74286
74371
74475
74649
75456
75463
75504
75530
75632
75714
76622
77780
77911
77952
78263
78330
78351
78480
78525
78535
78554
78555
78556
79488
79599
79607
79666
79833
80025
80379
80409
80443
80535
80580
80613
81105
81566
81655
81796
82276
82735
83237
83408
83655
83660
83819
83938
84390
84730
85000
85508
85550
85690
85751
85970
86481
86703
86775
87092
87116
87159
87518
87990
88063
88271
88482
88739
88938
88962
89109
90383
90463
90750
90817
90931
91179
91330
91409
91480
91548
91680
91707
92090
92354
92726
92761
93188
93321
93501
93692
93694
93746
93965
94236
94347
94774
94775
94897
94940
95041
95144
95218
95255
95307
95364
95423
95509
95685
96012
96032
96152
96443
96538
96771
96946
97159
97595
98123
98246
98294
98399
99293
99416
99472
100061
100213
100360
100385
100549
100558
100716
101032
101452
101471
101561
101610
101708
101735
102019
102020
102056
102491
102655
102664
102666
102695
102830
102845
102936
103123
103622
103718
104127
104567
104846
105520
105670
106047
106392
106615
108226
110520
111096
111270
114153
115771
115799
116333
116602
116836
117252
119774
121191
121746
121755
124272
124412
124638
124874
125146
125259
125466
125481
125482
126205
126513
126690
126720
126990
127104
127406
128065
128071
128109
128200
128433
128658
128755
128786
128830
128892
129293
129294
129435
129601
129615
129688
129737
129808
129844
129917
130044
130080
130114
130308
130344
130392
130426
130465
130727
130739
131075
132021
132107
132308
132329
132335
132440
132859
133160
133285
133427
133629
133826
134072
134376
134445
134472
134478
134652
134692
134701
134916
134929
134941
134988
134989
135033
135238
135289
135292
135480
135490
135523
135768
135780
136418
136426
136461
136497
136845
136881
136905
136939
137599
137676
137712
137983
138063
138085
138256
138466
138826
138975
139178
139312
139526
139575
139644
139937
140118
140296
140428
140879
141336
141352
141655
141719
141722
142040
142845
142886
143324
143998
144085
144248
144256
144265
144285
145022
145224
145273
145472
145526
145574
148321
148515
148579
148746
148860
149739
150939
151252
151615
152493
153227
153923
153989
154064
154353
154613
155083
155189
155559
155664
155701
156278
156365
156872
156942
157125
157144
157373
157490
157521
157697
157831
157976
158027
158033
158034
158253
158260
158302
158642
158833
158876
158899
159022
159363
159373
159458
159678
159968
160702
160732
160744
160777
160779
161044
161104
161126
161189
161247
161272
161300
161314
161317
161320
161365
161371
161380
161680
161715
162249
162417
162460
162495
162497
162614
162722
162776
163253
163254
163655
163825
163963
164275
164293
164371
164409
164462
164476
164494
164527
164659
164849
164983
164992
164999
165086
165149
165423
165478
165565
165646
165674
165676
165770
165832
166449
166456
166636
166653
166769
167041
167706
167727
167734
167798
167960
168135
168770
168818
168934
168937
168959
168965
169072
169245
169291
169340
169828
169941
169946
170531
171058
171245
171320
171430
171488
171491
171547
171699
171973
172154
172289
172338
172380
172391
172489
172640
172834
172892
172981
173052
173376
173412
173442
173472
173623
173932
173951
174664
174672
174759
175248
175674
176137
176172
176512
176680
176708
176836
177037
177199
177352
177637
177856
178061
178250
178339
178608
178718
178785
179782
180452
180476
180631
181406
181625
181648
181849
181972
182050
182178
182484
182622
182625
182668
182758
182824
182962
183050
183258
183260
183337
183373
183446
183666
183701
183720
183744
183877
183987
183988
184024
184153
184340
184346
184391
184484
184539
184802
184993
185799
187952
187977
188959
189212
189296
190009
190696
190823
191865
191898
192207
193349
194120
194612
194856
195004
195124
195134
195212
195220
195225
195351
195836
195922
195973
196043
196177
196207
196254
196390
197030
197327
197462
197937
198015
198018
198381
198403
198512
199042
199088
199148
199687
199802
199866
199943
200047
200516
200728
201258
201340
201401
201430
201460
201541
201697
201725
201864
201999
202159
202265
202467
202534
202656
202824
202845
202955
203252
203356
203405
203419
203572
203668
203689
204085
204114
204207
204213
204627
204678
204683
204746
204857
205368
205448
205522
205643
205946
206391
206416
206596
206657
206737
206923
207427
207509
207758
207761
207807
207842
208300
208370
208619
208707