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ilus:跑测试数据,没有报错,但同样没有运行程序,没有目标文件生成 #2

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Li-Yaoting opened this issue Aug 1, 2021 · 2 comments

Comments

@Li-Yaoting
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树嘉大大您好:
我是中山大学的在读博士liyt,关注您的公众号一段时间,作为生信小白,最近见您发表了ilus工具,立刻想研究学习,已按照您的yaml模板和fastq.list模板改写了本地模板(因上传的原因将文件后缀改为.txt),见附件,并在windows10的WSL下的conda环境下试运行,输出“** WGS done, 0 seconds elapsed **”,但没有运行程序,我不知道原因为何,想向您请假。第一次在github提iusse,还请多多指教,谢谢。
命令行
Input.txt
ilus_HGDP_210801.txt

Email: 61595554@qq.com

@ShujiaHuang
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Owner

ShujiaHuang commented Aug 5, 2021

树嘉大大您好:
我是中山大学的在读博士liyt,关注您的公众号一段时间,作为生信小白,最近见您发表了ilus工具,立刻想研究学习,已按照您的yaml模板和fastq.list模板改写了本地模板(因上传的原因将文件后缀改为.txt),见附件,并在windows10的WSL下的conda环境下试运行,输出“** WGS done, 0 seconds elapsed **”,但没有运行程序,我不知道原因为何,想向您请假。第一次在github提iusse,还请多多指教,谢谢。
命令行
Input.txt
ilus_HGDP_210801.txt

Email: 61595554@qq.com

ilus 不会主动运行你的任务的,只生成整个流程的执行脚本,你在 00.shell 目录下可以看到对应步骤的shell bash脚本,从 step1到step6,你按顺序投递这些任务就可以了,这个我在原来的公众号文章也有详细描述。

@Li-Yaoting
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感谢树嘉大大答疑

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