From c3ff28d3af58268dabbfb38a3acbe93b42f24540 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: nayib-jose-gloria <55710092+nayib-jose-gloria@users.noreply.github.com> Date: Mon, 28 Oct 2024 00:25:41 +0000 Subject: [PATCH] chore: update ontology descendant mappings Signed-off-by: github-actions[bot] <41898282+github-actions[bot]@users.noreply.github.com> --- ontology-assets/cell_type_descendants.json | 356 ++++++++------------- ontology-assets/tissue_descendants.json | 82 ++++- 2 files changed, 206 insertions(+), 232 deletions(-) diff --git a/ontology-assets/cell_type_descendants.json b/ontology-assets/cell_type_descendants.json index f7d07623..e23be383 100644 --- a/ontology-assets/cell_type_descendants.json +++ b/ontology-assets/cell_type_descendants.json @@ -23,6 +23,7 @@ "CL:0002320": [ "CL:0000057", "CL:0000058", + "CL:0000060", "CL:0000062", "CL:0000134", "CL:0000135", @@ -77,6 +78,7 @@ "CL:1000309", "CL:1000311", "CL:1000692", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:1001607", "CL:1001609", @@ -90,6 +92,7 @@ "CL:4023056", "CL:4028004", "CL:4028006", + "CL:4030022", "CL:4033016", "CL:4033018", "CL:4033026", @@ -116,6 +119,7 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -139,11 +143,13 @@ "CL:0002470", "CL:0002477", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0011031", "CL:1000353", "CL:1000695", "CL:1000698", + "CL:1000742", "CL:1001603", "CL:2000055", "CL:3000001", @@ -151,10 +157,10 @@ "CL:4033043" ], "CL:0000066": [ + "CL:0000060", "CL:0000065", "CL:0000067", "CL:0000068", - 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"CL:0009092", "CL:0011101", "CL:2000002", "CL:2000060" @@ -1521,10 +1480,10 @@ "CL:0000388", "CL:0000650", "CL:0000669", - "CL:0000676", "CL:0002503", "CL:0002547", "CL:0009089", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -1576,12 +1535,15 @@ "CL:0000669", "CL:0000881", "CL:0002539", + "CL:0002590", "CL:0002591", "CL:0005021", "CL:0005022", "CL:0008034", + "CL:0008035", "CL:0009089", "CL:0019018", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -1601,6 +1563,7 @@ "CL:0001042", "CL:0001043", "CL:0001044", + "CL:0001087", "CL:0001204", "CL:0002038", "CL:0002677", @@ -1609,6 +1572,7 @@ ], "CL:0000625": [ "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000900", "CL:0000906", "CL:0000907", @@ -1633,6 +1597,7 @@ "CL:0000791", "CL:0000792", "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000796", "CL:0000798", "CL:0000800", @@ -1678,6 +1643,7 @@ "CL:0001049", "CL:0001050", "CL:0001062", + "CL:0001087", "CL:0001203", "CL:0001204", "CL:0002038", @@ -1759,12 +1725,14 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000867", "CL:0000878", "CL:0000879", "CL:0000881", "CL:0000890", "CL:0002477", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:1000695", "CL:1000698", @@ -1791,6 +1759,7 @@ "CL:0000791", "CL:0000792", "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000796", "CL:0000798", "CL:0000800", @@ -1875,6 +1844,7 @@ "CL:0001080", "CL:0001081", "CL:0001082", + "CL:0001087", "CL:0001203", "CL:0001204", "CL:0002038", @@ -1941,6 +1911,7 @@ "CL:0000791", "CL:0000792", "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000796", "CL:0000798", "CL:0000800", @@ -1969,6 +1940,7 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -2044,6 +2016,7 @@ "CL:0001080", "CL:0001081", "CL:0001082", + "CL:0001087", "CL:0001203", "CL:0001204", "CL:0002038", @@ -2070,6 +2043,7 @@ "CL:0002629", "CL:0002677", "CL:0002678", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0009111", "CL:0009112", @@ -2132,6 +2106,7 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -2152,7 +2127,6 @@ "CL:0002154", "CL:0002193", "CL:0002355", - "CL:0002357", "CL:0002361", "CL:0002393", "CL:0002394", @@ -2165,6 +2139,7 @@ "CL:0002470", "CL:0002477", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0011031", "CL:1000695", @@ -2228,6 +2203,7 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -2251,10 +2227,12 @@ "CL:0002470", "CL:0002477", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0011031", "CL:1000695", "CL:1000698", + "CL:1000742", "CL:1001603", "CL:2000055", "CL:3000001", @@ -2328,9 +2306,9 @@ "CL:4023026", "CL:4023029", "CL:4023036", + "CL:4023064", "CL:4023065", "CL:4023069", - "CL:4023070", "CL:4023083", "CL:4023121", "CL:4030027" @@ -2369,6 +2347,7 @@ "CL:0008031", "CL:0010011", "CL:0011005", + "CL:1001569", "CL:4023011", "CL:4023015", "CL:4023016", @@ -2378,7 +2357,6 @@ "CL:4023063", "CL:4023064", "CL:4023069", - "CL:4023070", "CL:4023083", "CL:4023121", "CL:4023161", @@ -2411,6 +2389,7 @@ "CL:0002573", "CL:0002576", "CL:0002603", + "CL:0002604", "CL:0002605", "CL:0002626", "CL:0002627", @@ -2448,11 +2427,14 @@ "CL:0000695", "CL:0000740", "CL:0001031", + "CL:0001033", "CL:0003001", "CL:4023032", "CL:4023033", "CL:4023188", "CL:4023189", + "CL:4033046", + "CL:4033047", "CL:4033051", "CL:4033052", "CL:4033053" @@ -2507,6 +2489,7 @@ "CL:0000761", "CL:0000850", "CL:0001031", + "CL:0001033", "CL:0002608", "CL:0003001", "CL:0003050", @@ -2537,6 +2520,8 @@ "CL:1001451", "CL:1001474", "CL:1001509", + "CL:1001569", + "CL:1001571", "CL:1001611", "CL:2000029", "CL:2000032", @@ -2571,7 +2556,6 @@ "CL:4023065", "CL:4023068", "CL:4023069", - "CL:4023070", "CL:4023083", "CL:4023120", "CL:4023121", @@ -2599,6 +2583,8 @@ "CL:4033034", "CL:4033035", "CL:4033036", + "CL:4033046", + "CL:4033047", "CL:4033051", "CL:4033052", "CL:4033053" @@ -2606,6 +2592,7 @@ "CL:0000669": [ "CL:0000650", "CL:0009089", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -2658,6 +2645,7 @@ "CL:4023056", "CL:4028004", "CL:4028006", + "CL:4030022", "CL:4033026" ], "CL:0000152": [ @@ -2665,9 +2653,9 @@ "CL:0002064", "CL:0002325", "CL:0002623", + "CL:1001596", "CL:4033005", - "CL:4033037", - "CL:4033058" + "CL:4033037" ], "CL:0000163": [ "CL:0000164", @@ -2699,6 +2687,7 @@ "CL:0000071", "CL:0000131", "CL:0000132", + "CL:0000666", "CL:0000704", "CL:0002138", "CL:0002139", @@ -2728,6 +2717,7 @@ "CL:1000892", "CL:1001005", "CL:1001033", + "CL:1001036", "CL:1001096", "CL:1001099", "CL:1001131", @@ -2747,20 +2737,29 @@ "CL:4033008" ], "CL:0002076": [ + "CL:0000082", + "CL:0000083", "CL:0000155", "CL:0000158", "CL:0000162", + "CL:0000169", + "CL:0000171", + "CL:0000173", "CL:0000209", "CL:0000307", + "CL:0000322", "CL:0000508", "CL:0000510", "CL:0000577", "CL:0000584", "CL:0000682", + "CL:0002062", + "CL:0002063", + "CL:0002064", "CL:0002071", "CL:0002075", + "CL:0002079", "CL:0002145", - 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