From 171f8d8c6d5a20d0ef2345586dd33c67a68b8109 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: GeraldineGomez Date: Fri, 22 Nov 2024 09:11:02 -0500 Subject: [PATCH] chore(calcular_incidencia_geo): add interactive for cache param Ref: #206 --- R/checking_data.R | 28 ++++++++-------------------- man/calcular_incidencia_geo.Rd | 14 ++++++++------ 2 files changed, 16 insertions(+), 26 deletions(-) diff --git a/R/checking_data.R b/R/checking_data.R index 753ad46d..b39d1e49 100644 --- a/R/checking_data.R +++ b/R/checking_data.R @@ -1050,9 +1050,6 @@ calcular_incidencia <- function(data_incidencia = NULL, #' @param ruta_dir Un `character` (cadena de caracteres) que especifica la ruta #' del directorio donde se almacenarán la población a riesgo o las proyecciones #' poblacionales DANE. Su valor por defecto es `NULL`. -#' @param ruta_dir Un `character` (cadena de caracteres) que especifica la ruta -#' del directorio donde se almacenarán la población a riesgo o las proyecciones -#' poblacionales DANE. Su valor por defecto es `NULL`. #' @param cache Un `logical` (`TRUE` o `FALSE`) que indica si la población a #' riesgo o las proyecciones poblacionales DANE descargadas deben ser #' almacenados en caché. Su valor por defecto es `FALSE`. @@ -1073,12 +1070,14 @@ calcular_incidencia <- function(data_incidencia = NULL, #' data_limpia <- limpiar_data_sivigila(data_event = dengue2020) #' data_agrupada_mpios <- agrupar_mpio(data_limpia, dpto = "Antioquia") #' # Cálculo de la incidencia con población a riesgo por departamento -#' calcular_incidencia_geo( -#' poblacion = "riesgo", -#' data_agrupada = data_agrupada_mpios, -#' year = 2020, -#' ruta_dir = tempdir() -#' ) +#' if (interactive()) { +#' calcular_incidencia_geo( +#' poblacion = "riesgo", +#' data_agrupada = data_agrupada_mpios, +#' year = 2020, +#' cache = TRUE +#' ) +#' } #' data_agrupada_dptos <- agrupar_dpto(data_limpia) #' # Cálculo de la incidencia con proyecciones poblacionales para Colombia #' calcular_incidencia_geo( @@ -1086,15 +1085,12 @@ calcular_incidencia <- function(data_incidencia = NULL, #' data_agrupada = data_agrupada_dptos, #' year = 2020, #' ruta_dir = tempdir() -#' year = 2020, -#' ruta_dir = tempdir() #' ) #' } #' @export calcular_incidencia_geo <- function(data_incidencia = NULL, cache = FALSE, ruta_dir = NULL, - ruta_dir = NULL, data_agrupada, poblacion = NULL, year = NULL) { @@ -1118,8 +1114,6 @@ calcular_incidencia_geo <- function(data_incidencia = NULL, year = year, cache = cache, ruta_dir = ruta_dir - cache = cache, - ruta_dir = ruta_dir ) data_incidencia <- pop_incidencia$data_incidencia poblacion <- pop_incidencia$poblacion @@ -1149,9 +1143,6 @@ calcular_incidencia_geo <- function(data_incidencia = NULL, year = year, cache = cache, ruta_dir = ruta_dir - year = year, - cache = cache, - ruta_dir = ruta_dir ) geo_incidencia[fila] <- incidencia$incidencia } @@ -1182,9 +1173,6 @@ calcular_incidencia_geo <- function(data_incidencia = NULL, year = year, cache = cache, ruta_dir = ruta_dir - year = year, - cache = cache, - ruta_dir = ruta_dir ) geo_incidencia[fila] <- incidencia$incidencia } diff --git a/man/calcular_incidencia_geo.Rd b/man/calcular_incidencia_geo.Rd index 3929ed19..0f9b4979 100644 --- a/man/calcular_incidencia_geo.Rd +++ b/man/calcular_incidencia_geo.Rd @@ -51,12 +51,14 @@ data(dengue2020) data_limpia <- limpiar_data_sivigila(data_event = dengue2020) data_agrupada_mpios <- agrupar_mpio(data_limpia, dpto = "Antioquia") # Cálculo de la incidencia con población a riesgo por departamento -calcular_incidencia_geo( - poblacion = "riesgo", - data_agrupada = data_agrupada_mpios, - year = 2020, - ruta_dir = tempdir() -) +if (interactive()) { + calcular_incidencia_geo( + poblacion = "riesgo", + data_agrupada = data_agrupada_mpios, + year = 2020, + cache = TRUE + ) +} data_agrupada_dptos <- agrupar_dpto(data_limpia) # Cálculo de la incidencia con proyecciones poblacionales para Colombia calcular_incidencia_geo(