-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
Merge branch 'main' of github.com:morinlab/LLMPP
- Loading branch information
Showing
1 changed file
with
54 additions
and
54 deletions.
There are no files selected for viewing
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Original file line number | Diff line number | Diff line change |
|---|---|---|
| @@ -1,54 +1,54 @@ | ||
| Gene curated Bea Zhang Pararajalingam Nadeu Other_support appx_overall_freq gambl_freq common_alias noncoding_driver_suspect aSHM CIViC | ||
| ATM TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 45 45.02 NA NA NA TRUE | ||
| BCOR TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 3.79 NA NA NA FALSE | ||
| BIRC3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 10 7.11 NA NA NA TRUE | ||
| CARD11 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 1.42 NA NA NA TRUE | ||
| CCND1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 14.69 NA NA TRUE TRUE | ||
| DAZAP1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 4.27 NA NA NA TRUE | ||
| EWSR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE 35963941 0 3.32 NA NA NA TRUE | ||
| HNRNPH1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 3.79 NA TRUE NA TRUE | ||
| KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 20 16.59 MLL2 NA NA TRUE | ||
| MEF2B TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE | ||
| NOTCH1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 5 5.21 NA NA NA TRUE | ||
| NOTCH2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 2.84 NA NA NA TRUE | ||
| NSD2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 7.11 WHSC1 NA NA TRUE | ||
| RB1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE 35963941 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| S1PR1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE | ||
| SMARCA4 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE | ||
| SP140 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 10 5.21 NA NA NA TRUE | ||
| SYNE1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE | ||
| TERT TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| TLR2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| TP53 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE | ||
| UBR5 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE | ||
| NFKBIE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE GAMBL 5 2.84 NA NA NA TRUE | ||
| POT1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE GAMBL 0 3.32 NA NA NA FALSE | ||
| ANK2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE | ||
| ARID1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 35963941 0 1.9 NA NA NA FALSE | ||
| ATP11C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| B2M FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA TRUE | ||
| CDH8 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| COL11A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| COL16A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE | ||
| CTNNA2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| DHDH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| DLC1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE | ||
| EIF2AK4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| ESX1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| FAT4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 3.79 NA NA NA FALSE | ||
| GRIN2A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| HEPH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE | ||
| KMT2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 5 0.47 MLL3 NA NA FALSE | ||
| MRGPRF FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| NIN FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| OGDHL FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE | ||
| PCDHB2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE | ||
| PLXNB3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| ROBO2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE | ||
| SALL3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE | ||
| SI FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE | ||
| SMARCB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 1.9 NA NA NA FALSE | ||
| SMC1A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| TBC1D26 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| ZNF117 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| ZNF296 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE | ||
| Gene curated Bea Zhang Pararajalingam Nadeu Other_support appx_overall_freq gambl_freq common_alias noncoding_driver_suspect aSHM CIViC earliest_support | ||
| ATM TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 45 45.02 NA NA NA TRUE 24145436 | ||
| BCOR TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 3.79 NA NA NA FALSE 32584970 | ||
| BIRC3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 10 7.11 NA NA NA TRUE 24145436 | ||
| CARD11 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 1.42 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| CCND1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 14.69 NA NA TRUE TRUE 24145436 | ||
| DAZAP1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 4.27 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| EWSR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE 35963941 0 3.32 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| HNRNPH1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 3.79 NA TRUE NA TRUE 32160292 | ||
| KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 20 16.59 MLL2 NA NA TRUE 24145436 | ||
| MEF2B TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE 24145436 | ||
| NOTCH1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 5 5.21 NA NA NA TRUE 24145436 | ||
| NOTCH2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 2.84 NA NA NA TRUE 24145436 | ||
| NSD2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 7.11 WHSC1 NA NA TRUE 24145436 | ||
| RB1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE 35963941 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| S1PR1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| SMARCA4 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE 32584970 | ||
| SP140 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 10 5.21 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| SYNE1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE 32584970 | ||
| TERT TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE 32584970 | ||
| TLR2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE 24145436 | ||
| TP53 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| UBR5 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| NFKBIE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE GAMBL 5 2.84 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| POT1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE GAMBL 0 3.32 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ANK2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ARID1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 35963941 0 1.9 NA NA NA FALSE | ||
| ATP11C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| B2M FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA TRUE 32160292 | ||
| CDH8 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| COL11A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| COL16A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| CTNNA2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| DHDH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| DLC1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| EIF2AK4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ESX1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| FAT4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 3.79 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| GRIN2A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| HEPH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| KMT2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 5 0.47 MLL3 NA NA FALSE 34001881 | ||
| MRGPRF FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| NIN FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| OGDHL FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| PCDHB2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| PLXNB3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ROBO2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| SALL3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| SI FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| SMARCB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 1.9 NA NA NA FALSE 32584970 | ||
| SMC1A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| TBC1D26 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ZNF117 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 | ||
| ZNF296 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881 |