From 42379182f471ab6befae4fa1dfec75bfb67439e1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: rdmorin Date: Thu, 18 Apr 2024 09:35:29 -0700 Subject: [PATCH] update original publications --- resources/curated/fl_genes.tsv | 40 +++++++++++++++++----------------- 1 file changed, 20 insertions(+), 20 deletions(-) diff --git a/resources/curated/fl_genes.tsv b/resources/curated/fl_genes.tsv index ff205459..9f42171f 100644 --- a/resources/curated/fl_genes.tsv +++ b/resources/curated/fl_genes.tsv @@ -4,38 +4,38 @@ ACTB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE aSHM ARID1A FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE ATP6AP1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE ATP6V1B2 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE -B2M TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +B2M TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 BCL10 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 -BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 BCL6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE 37084389 aSHM BCL7A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE aSHM BIRC6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE aSHM -BTG2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE aSHM +BTG2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE 21796119 aSHM BTK FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE CILP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 CYP2A6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 -CARD11 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE -CCND3 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE +CARD11 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 +CCND3 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE 21796119 CD70 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 CD79B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE CD83 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 aSHM -CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE +CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 CTSS FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE DDX3X TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 37084389 DTX1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE DUSP2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE EBF1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE -EP300 FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE +EP300 FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -FAS TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE -FOXO1 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +FAS TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE 21796119 +FOXO1 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 GRM6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 GBP7 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 -GNA13 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +GNA13 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 GNAI2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE HIST1H1B TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE aSHM -HIST1H1C TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE aSHM +HIST1H1C TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE 21796119 aSHM HIST1H1D FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE aSHM HIST1H1E TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE aSHM HIST1H2AC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE aSHM @@ -54,17 +54,17 @@ HNRNPD TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE ID3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 IGLL5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 aSHM/SHM. Unclear if this should be considered a gene IRF4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE LBCL-IRF4 -IRF8 FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE aSHM +IRF8 FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 aSHM ITPKB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE KIR3DL1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 KLF2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE -KLHL6 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE -KMT2D TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +KLHL6 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 +KMT2D TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 LTB FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE MAGEC1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 MAP2K1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE 27325104 PTNFL MAP7D1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 -MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 MEF2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE MKI67 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 MYC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE @@ -82,7 +82,7 @@ RRAGC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE S1PR2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE SESN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 28659443 STAB2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 -SGK1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +SGK1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 SOCS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE SHROOM3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 SMARCA4 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 @@ -90,10 +90,10 @@ SRRM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TBL1XR1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE TMSB4X TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE -TMEM30A FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 -TNFAIP3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 -TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -TP53 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +TMEM30A FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 21796119 +TNFAIP3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE 21796119 +TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 +TP53 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE 21796119 VMA21 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE XIRP2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986