diff --git a/resources/curated/fl_genes.tsv b/resources/curated/fl_genes.tsv index e8e8b01d..1e1c1147 100644 --- a/resources/curated/fl_genes.tsv +++ b/resources/curated/fl_genes.tsv @@ -1,74 +1,99 @@ -gene Dreval Crouch de_Leval Kalmbach curated Other_source Comment -ACTB TRUE FALSE FALSE TRUE -ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE -ATP6AP1 TRUE FALSE TRUE TRUE -ATP6V1B2 TRUE FALSE TRUE TRUE -B2M TRUE FALSE TRUE TRUE -BCL2 TRUE TRUE TRUE TRUE -BCL7A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE -BIRC6 TRUE FALSE FALSE TRUE -BTG1 TRUE TRUE TRUE TRUE -BTG2 TRUE TRUE FALSE TRUE -BTK FALSE FALSE TRUE TRUE -CARD11 FALSE FALSE TRUE TRUE -CCND3 TRUE FALSE FALSE TRUE -CD79B TRUE FALSE FALSE TRUE -CD83 TRUE TRUE FALSE FALSE -CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -CTSS FALSE FALSE TRUE TRUE -DDX3X TRUE FALSE FALSE FALSE -DTX1 TRUE TRUE FALSE TRUE -EBF1 FALSE FALSE TRUE TRUE -EP300 FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE -EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -FAS TRUE FALSE FALSE TRUE -FOXO1 FALSE TRUE TRUE TRUE -GNA13 TRUE FALSE TRUE TRUE -GNAI2 FALSE FALSE FALSE TRUE -HIST1H1B TRUE TRUE FALSE TRUE -HIST1H1C TRUE TRUE TRUE TRUE -HIST1H1D FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H1E TRUE TRUE TRUE TRUE -HIST1H2AC FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H2AG FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H2AM FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H2BC FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H2BD FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H2BG FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H3B FALSE TRUE FALSE TRUE -HIST1H3G FALSE TRUE FALSE TRUE -HVCN1 FALSE FALSE TRUE TRUE -IRF8 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE -ITPKB TRUE FALSE FALSE TRUE -KLF2 TRUE FALSE FALSE TRUE -KLHL6 FALSE FALSE TRUE TRUE -KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE -LTB FALSE FALSE TRUE TRUE -MAP2K1 FALSE FALSE TRUE TRUE 27325104 PTNFL -MEF2B TRUE TRUE TRUE TRUE -MEF2C FALSE FALSE TRUE TRUE -MYC FALSE TRUE FALSE FALSE -MYD88 TRUE FALSE FALSE FALSE -P2RY8 TRUE FALSE FALSE FALSE -PCLO TRUE FALSE FALSE TRUE -PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE -POU2AF1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE -POU2F2 FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE -PTPRD TRUE FALSE FALSE TRUE -RRAGC TRUE FALSE TRUE TRUE -S1PR2 FALSE FALSE TRUE TRUE -SESN1 FALSE FALSE FALSE FALSE 28659443 -SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE -SOCS1 TRUE TRUE TRUE TRUE -STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -TBL1XR1 TRUE FALSE FALSE TRUE -TMSB4X TRUE FALSE FALSE TRUE -TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE -TP53 TRUE FALSE TRUE TRUE -VMA21 TRUE FALSE FALSE TRUE -IRF4 FALSE FALSE FALSE TRUE LBCL-IRF4 -ABL2 FALSE FALSE FALSE TRUE -KIR3DL1 FALSE FALSE FALSE TRUE -MAGEC1 FALSE FALSE FALSE TRUE -GBP7 FALSE FALSE FALSE TRUE -MAP7D1 FALSE FALSE FALSE TRUE +gene Dreval Crouch de_Leval Kalmbach Russler-Germain curated First_description Comment +ABL2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 +ACTB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE aSHM +ARID1A FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE +ATP6AP1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +ATP6V1B2 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +B2M TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +BCL10 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +BCL6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE 37084389 aSHM +BCL7A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE aSHM +BIRC6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE +BTG2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE +BTK FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +CILP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +CYP2A6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +CARD11 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +CCND3 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE +CD70 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +CD79B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE +CD83 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 +CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE +CTSS FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +DDX3X TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 37084389 +DTX1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +DUSP2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE +EBF1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +EP300 FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE +EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE +FAS TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE +FOXO1 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +GRM6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +GBP7 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 +GNA13 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +GNAI2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H1B TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H1C TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE +HIST1H1D FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE +HIST1H1E TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +HIST1H2AC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE +HIST1H2AG FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H2AM FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE +HIST1H2BC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H2BD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H2BG FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H2BM FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +HIST1H3B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE +HIST1H3I FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +HIST1H3G FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE +HLA-B TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE +HVCN1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +HNRNPD TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE +ID3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +IGLL5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +IRF4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE LBCL-IRF4 +IRF8 FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE +ITPKB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +KIR3DL1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 +KLF2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +KLHL6 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +KMT2D TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +LTB FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +MAGEC1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 +MAP2K1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE 27325104 PTNFL +MAP7D1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37563306 +MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +MEF2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +MKI67 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +MYC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE +MYD88 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE +NFKBIA FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +OR8H2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +P2RY8 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE +PCLO TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +PIM1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +POU2AF1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE +POU2F2 FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE +PTPRD TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +PZP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +RRAGC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +S1PR2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE +SESN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 28659443 +STAB2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +SGK1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +SOCS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE +SHROOM3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +SMARCA4 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +SRRM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE +TBL1XR1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE +TMSB4X TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +TMEM30A FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +TNFAIP3 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986 +TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE +TP53 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE +VMA21 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE +ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE +XIRP2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37493986