From 8cfe96f32b2d0302beff3a188a5c8997b82aa43a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: rdmorin Date: Thu, 25 Apr 2024 11:51:42 -0700 Subject: [PATCH] fill gaps --- resources/curated/PMBL_HL_MGZL.tsv | 108 +++++++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 108 insertions(+) create mode 100644 resources/curated/PMBL_HL_MGZL.tsv diff --git a/resources/curated/PMBL_HL_MGZL.tsv b/resources/curated/PMBL_HL_MGZL.tsv new file mode 100644 index 00000000..1753ab56 --- /dev/null +++ b/resources/curated/PMBL_HL_MGZL.tsv @@ -0,0 +1,108 @@ +Gene Curated PMBL_De_Leval MGZL_De_Leval CHL_De_Leval CHL_Wienand CHL_Gomez CHL_Alig CHL_Desch CHL_earliest_description +ACTB TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE NA +ACTG1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 31431735 +ADGRG6 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA +AXDND1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE 37910143 +ARID1A TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA +ARID5B TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +B2M TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA +BIRC6 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +BTG1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA +BCL7A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE NA +CARD11 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +CCND3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +CD58 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +CD83 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA +CDKN2A TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +CDH5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +CHD8 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +CHD2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +CIITA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 31431735 +CISH FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +CREBBP TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +CSF2RB TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE NA +DDX3X TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +DNAH12 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA +DTX1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +DUSP2 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +EBF1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +EEF1A1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA +EP300 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +EGR1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA +ETS1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +EWSR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +EZH2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +FAS TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +FAT1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +FAT4 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +GNA13 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA +H1-2 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +H1-3 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +H1-4 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +H1-5 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +HLA-A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 31431735 +HLA-B TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA +HLA-C FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA +IL4R TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE NA +IGLL5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA +IRF8 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +IRF4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +IKBKB FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE NA +ITPKB TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +ITGB2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +JAK1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +KLF2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 31431735 +KMT2C TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +KMT2D FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +LTB TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +LIMD2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +MS4A1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +MYB FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 31431735 +NFKBIA TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +NFKBIE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA +NFKB2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +NSD2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +OR13C2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +OSBPL10 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +P2RY8 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA +PCDH7 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +PCBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +PCLO TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +PHIP TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +PIM1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +PIM2 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +PRKDC TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +PTPN1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA +PTPRD TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +RDH12 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +RHOA TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +RBM38 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA +S1PR2 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +SCN9A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +SGK1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +SIN3A TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +SMAD3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA +SMARCA2 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +SMARCA4 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +SOCS1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA +SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +STAT3 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA +STRAP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 37910143 +TAP1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TBL1XR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TCF3 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TET3 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TMSB4X TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TNFAIP3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA +TNFRSF1B TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +TP53 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA +TRAF3 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA +UBE2A TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE NA +UBR5 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +UNC5C TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +VPS13B TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +WEE1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +XPO1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA +ZFP36L1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA +ZNF217 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA \ No newline at end of file