Skip to content

Commit

Permalink
mcl earl_sup
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
Houman committed Apr 26, 2024
1 parent 92e9186 commit 9746045
Showing 1 changed file with 54 additions and 54 deletions.
108 changes: 54 additions & 54 deletions resources/curated/mcl_genes.tsv
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,54 +1,54 @@
Gene curated Bea Zhang Pararajalingam Nadeu Other_support appx_overall_freq gambl_freq common_alias noncoding_driver_suspect aSHM CIViC
ATM TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 45 45.02 NA NA NA TRUE
BCOR TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 3.79 NA NA NA FALSE
BIRC3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 10 7.11 NA NA NA TRUE
CARD11 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 1.42 NA NA NA TRUE
CCND1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 14.69 NA NA TRUE TRUE
DAZAP1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 4.27 NA NA NA TRUE
EWSR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE 35963941 0 3.32 NA NA NA TRUE
HNRNPH1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 3.79 NA TRUE NA TRUE
KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 20 16.59 MLL2 NA NA TRUE
MEF2B TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE
NOTCH1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 5 5.21 NA NA NA TRUE
NOTCH2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 2.84 NA NA NA TRUE
NSD2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 7.11 WHSC1 NA NA TRUE
RB1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE 35963941 0 0.47 NA NA NA FALSE
S1PR1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE
SMARCA4 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE
SP140 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 10 5.21 NA NA NA TRUE
SYNE1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE
TERT TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE
TLR2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE
TP53 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE
UBR5 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE
NFKBIE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE GAMBL 5 2.84 NA NA NA TRUE
POT1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE GAMBL 0 3.32 NA NA NA FALSE
ANK2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE
ARID1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 35963941 0 1.9 NA NA NA FALSE
ATP11C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
B2M FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA TRUE
CDH8 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
COL11A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
COL16A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE
CTNNA2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
DHDH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
DLC1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE
EIF2AK4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
ESX1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
FAT4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 3.79 NA NA NA FALSE
GRIN2A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
HEPH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE
KMT2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 5 0.47 MLL3 NA NA FALSE
MRGPRF FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
NIN FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
OGDHL FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE
PCDHB2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE
PLXNB3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
ROBO2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE
SALL3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE
SI FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE
SMARCB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 1.9 NA NA NA FALSE
SMC1A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
TBC1D26 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
ZNF117 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
ZNF296 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE
Gene curated Bea Zhang Pararajalingam Nadeu Other_support appx_overall_freq gambl_freq common_alias noncoding_driver_suspect aSHM CIViC earliest_support
ATM TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 45 45.02 NA NA NA TRUE 24145436
BCOR TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 3.79 NA NA NA FALSE 32584970
BIRC3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 10 7.11 NA NA NA TRUE 24145436
CARD11 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 1.42 NA NA NA TRUE 32160292
CCND1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 14.69 NA NA TRUE TRUE 24145436
DAZAP1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 4.27 NA NA NA TRUE 32160292
EWSR1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE 35963941 0 3.32 NA NA NA TRUE 32160292
HNRNPH1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 3.79 NA TRUE NA TRUE 32160292
KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 20 16.59 MLL2 NA NA TRUE 24145436
MEF2B TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE 24145436
NOTCH1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 5 5.21 NA NA NA TRUE 24145436
NOTCH2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA 5 2.84 NA NA NA TRUE 24145436
NSD2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 15 7.11 WHSC1 NA NA TRUE 24145436
RB1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE 35963941 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
S1PR1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA 5 5.69 NA NA NA TRUE 32160292
SMARCA4 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE 32584970
SP140 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 10 5.21 NA NA NA TRUE 32160292
SYNE1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 5 4.74 NA NA NA FALSE 32584970
TERT TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE 32584970
TLR2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 0 0 NA NA NA FALSE 24145436
TP53 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE 32160292
UBR5 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 10 9 NA NA NA TRUE 32160292
NFKBIE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE GAMBL 5 2.84 NA NA NA TRUE 32160292
POT1 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE GAMBL 0 3.32 NA NA NA FALSE 34001881
ANK2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE 34001881
ARID1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 35963941 0 1.9 NA NA NA FALSE
ATP11C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
B2M FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA TRUE 32160292
CDH8 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
COL11A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
COL16A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881
CTNNA2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
DHDH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
DLC1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881
EIF2AK4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
ESX1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
FAT4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 3.79 NA NA NA FALSE 34001881
GRIN2A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
HEPH FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881
KMT2C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 5 0.47 MLL3 NA NA FALSE 34001881
MRGPRF FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
NIN FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
OGDHL FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881
PCDHB2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.47 NA NA NA FALSE 34001881
PLXNB3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
ROBO2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.9 NA NA NA FALSE 34001881
SALL3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0.95 NA NA NA FALSE 34001881
SI FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 1.42 NA NA NA FALSE 34001881
SMARCB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL 0 1.9 NA NA NA FALSE 32584970
SMC1A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
TBC1D26 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
ZNF117 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881
ZNF296 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 0 0 NA NA NA FALSE 34001881

0 comments on commit 9746045

Please sign in to comment.