From e953315679c9cb385f2d9b29fc62f2d5c82ce1bf Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: rdmorin Date: Tue, 23 Apr 2024 15:35:35 -0700 Subject: [PATCH] add hubschmann study --- .../dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv | 509 +++++++++--------- resources/curated/fl_genes.tsv | 215 ++++---- 2 files changed, 381 insertions(+), 343 deletions(-) diff --git a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv index 576fcbfe..e28e3c2a 100644 --- a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv +++ b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv @@ -1,244 +1,265 @@ -ensembl_gene_id Gene Chapuy Reddy LymphGen curated other_support Lacy aSHM earliest_support common_alias noncoding_driver_suspect GAMBL dlbcl_chapuy dlbcl_reddy dlbcl_schmitz -ENSG00000075624 ACTB TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 22343534 NA NA 8.6 12.4 6.3 9.8 -ENSG00000132466 ANKRD17 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.9 2.1 3.8 4.3 -ENSG00000117713 ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 8.4 4.3 4.4 8.9 -ENSG00000049618 ARID1B FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5 2.1 3.3 6 -ENSG00000150347 ARID5B FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.6 2.6 4.3 4.3 -ENSG00000149311 ATM FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 5.2 4.7 5.9 5.5 -ENSG00000175054 ATR FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.5 3.8 2.8 4.9 -ENSG00000166710 B2M TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 14 12 12.1 15.5 -ENSG00000142867 BCL10 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 6.4 3.1 7.7 -ENSG00000119866 BCL11A TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.6 3.4 1.6 4.5 -ENSG00000171791 BCL2 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 22.1 15.8 12.9 10.6 -ENSG00000113916 BCL6 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 13.3 5.1 6.4 9.8 -ENSG00000110987 BCL7A FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 8.8 6.4 8.4 10.6 -ENSG00000183337 BCOR FALSE FALSE FALSE TRUE Unpublished TRUE FALSE NA NA NA 2.9 2.6 2.5 7.7 -ENSG00000186716 BCR FALSE FALSE FALSE TRUE possibly_aSHM_only FALSE FALSE NA NA NA 4.5 4.3 3.9 6.4 -ENSG00000115760 BIRC6 FALSE TRUE FALSE TRUE PMID: 32961552 FALSE FALSE 28985567 NA NA 6.3 4.7 6.4 10 -ENSG00000157764 BRAF TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.5 5.6 2 3.4 -ENSG00000162670 BRINP3 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 FAM5C NA 2.7 3 3.3 3.4 -ENSG00000132640 BTBD3 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 0.9 1.8 1.9 -ENSG00000133639 BTG1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 9.7 14.5 7.5 14.5 -ENSG00000159388 BTG2 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 14 6 9.2 17.2 -ENSG00000010671 BTK FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.4 2.1 3.1 3.6 -ENSG00000198286 CARD11 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.9 8.1 7.8 15.3 -ENSG00000064012 CASP8 FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.7 1.3 1.2 1.1 -ENSG00000114423 CBLB FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 1.7 1.6 2.8 -ENSG00000129277 CCL4 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 1.3 0.6 1.5 -ENSG00000112576 CCND3 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 6.8 4.7 3.8 9.8 -ENSG00000012124 CD22 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 3 2.8 1.7 -ENSG00000120217 CD274 TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 21796119 NA NA 0.5 2.6 1.3 2.3 -ENSG00000135218 CD36 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.5 3 2.8 4.9 -ENSG00000116815 CD58 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 8.4 6.8 2.8 10 -ENSG00000125726 CD70 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5.6 7.7 6.9 9.4 -ENSG00000007312 CD79B TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.5 15.4 8.3 14.9 -ENSG00000112149 CD83 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 4.5 7.3 5.8 5.7 -ENSG00000134371 CDC73 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 1.3 0.7 0.6 -ENSG00000147889 CDKN2A FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 2.9 1.7 1 6 -ENSG00000153922 CHD1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.1 2.9 3 -ENSG00000100888 CHD8 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 3 2.9 3.6 -ENSG00000175040 CHST2 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 0.4 0.7 2.3 -ENSG00000179583 CIITA TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 2.5 4.3 4.3 6.6 -ENSG00000167186 COQ7 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 0.4 0.5 0.6 -ENSG00000005339 CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 21.4 16.7 12.1 17.9 -ENSG00000213145 CRIP1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 3 0.7 1.9 -ENSG00000121966 CXCR4 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23131835 NA NA 2.7 2.6 1.5 2.6 -ENSG00000071626 DAZAP1 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 0.4 1.6 5.3 -ENSG00000143164 DCAF6 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 1.3 1.3 2.3 -ENSG00000178105 DDX10 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 1.7 0.8 1.5 -ENSG00000215301 DDX3X FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 29641966 NA NA 8.6 5.6 4.5 4.7 -ENSG00000100697 DICER1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.6 1.1 2.3 -ENSG00000119772 DNMT3A FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 0.7 1.3 1.4 2.1 -ENSG00000150760 DOCK1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.8 6 4.9 10.2 -ENSG00000135144 DTX1 TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 10.2 11.5 5.9 13.6 -ENSG00000158050 DUSP2 FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 9.3 4.3 9.7 12.6 -ENSG00000164330 EBF1 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23174882 NA NA 8.8 12.8 8.8 10.9 -ENSG00000156508 EEF1A1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 33945543 NA NA 4.1 4.7 2.5 3 -ENSG00000100393 EP300 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 9.5 8.1 7.1 9.8 -ENSG00000134954 ETS1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 21796119 NA NA 5.4 5.6 4.4 7.9 -ENSG00000139083 ETV6 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.6 10.3 5.8 10.4 -ENSG00000106462 EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 20081860 NA NA 12.2 5.6 8.9 9.1 -ENSG00000026103 FAS TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 8.8 9 4.7 10.9 -ENSG00000138081 FBXO11 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL TRUE FALSE NA NA NA 4.1 2.6 2.1 2.1 -ENSG00000109670 FBXW7 FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 1.7 1.3 3 -ENSG00000054598 FOXC1 FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.7 0.9 1.2 4.5 -ENSG00000150907 FOXO1 FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 10.6 2.1 2.4 7.2 -ENSG00000114861 FOXP1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 0.7 3 2.1 1.9 -ENSG00000162613 FUBP1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 0.9 1.5 1.5 -ENSG00000130383 FUT5 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 1.3 0.3 1.3 -ENSG00000151834 GABRA2 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.9 1.3 1.2 2.6 -ENSG00000120063 GNA13 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.7 10.3 11.9 8.5 -ENSG00000114353 GNAI2 TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.7 3.8 1.9 6.4 -ENSG00000087460 GNAS FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2 1.3 1.9 3.2 -ENSG00000066455 GOLGA5 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 1.3 1.9 0.9 -ENSG00000177885 GRB2 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.4 3 1.5 2.8 -ENSG00000137106 GRHPR TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.7 4.7 3.6 4.5 -ENSG00000184357 HIST1H1B TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.3 9.8 7.3 8.5 -ENSG00000187837 HIST1H1C TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.7 12.4 9.4 9.8 -ENSG00000124575 HIST1H1D TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.5 7.7 6.1 5.7 -ENSG00000168298 HIST1H1E TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 16.5 11.5 14.5 17.9 -ENSG00000180573 HIST1H2AC TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.9 6.4 3.4 6.2 -ENSG00000233224 HIST1H2AM TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.1 6 4.8 5.7 -ENSG00000180596 HIST1H2BC TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 28985567 NA NA 4.1 5.6 4.3 5.5 -ENSG00000197903 HIST1H2BK TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 5.4 5.6 4.2 4.9 -ENSG00000124693 HIST1H3B TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 2 2.1 2 1.7 -ENSG00000184678 HIST2H2BE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.7 3 2.6 3.2 -ENSG00000206503 HLA-A TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 8.8 9 0.2 11.1 -ENSG00000234745 HLA-B TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 9.5 10.7 1.2 16.4 -ENSG00000204525 HLA-C TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.1 4.7 NA 5.5 -ENSG00000204257 HLA-DMA TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.5 1.7 NA 1.3 -ENSG00000242574 HLA-DMB FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.4 1.7 NA 5.1 -ENSG00000138668 HNRNPD FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.7 0.9 1.8 2.1 -ENSG00000169045 HNRNPH1 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA TRUE 2 3.4 1.4 3.2 -ENSG00000153187 HNRNPU FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.8 3.4 2.4 3.4 -ENSG00000174775 HRAS FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA 0.4 0.7 0.2 -ENSG00000122986 HVCN1 TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.2 3.4 2.3 1.9 -ENSG00000117318 ID3 FALSE FALSE TRUE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 2 0.9 3.5 4.7 -ENSG00000254709 IGLL5 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 41.1 9 16.1 36 -ENSG00000104365 IKBKB FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 3.4 1.1 3 -ENSG00000161405 IKZF3 TRUE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28479318 NA NA 4.3 4.3 3.9 4.5 -ENSG00000172349 IL16 FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.3 5.1 2.8 3.8 -ENSG00000077238 IL4R FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 33684939 NA NA 2.5 3.8 2.5 2.1 -ENSG00000136244 IL6 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.5 1.7 1.2 2.8 -ENSG00000128908 INO80 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 3.4 2.5 4.3 -ENSG00000137265 IRF4 FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 3.2 2.1 4.4 7 -ENSG00000140968 IRF8 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 8.8 10.3 7.6 10.4 -ENSG00000143772 ITPKB FALSE FALSE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 6.5 9.4 6.7 6.8 -ENSG00000162434 JAK1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 2.9 2.1 2.2 1.9 -ENSG00000105639 JAK3 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 1.4 NA 1 1.3 -ENSG00000171223 JUNB FALSE TRUE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.9 2.1 3.5 3.2 -ENSG00000176407 KCMF1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.1 1 1.5 -ENSG00000127528 KLF2 FALSE FALSE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 7.7 3 2.1 7 -ENSG00000197705 KLHL14 FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5 7.3 4.6 6.6 -ENSG00000172578 KLHL6 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 5.2 9 6.4 9.1 -ENSG00000055609 KMT2C FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 MLL3 NA 2.9 6.4 7.3 8.3 -ENSG00000167548 KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 MLL2 NA 31.4 26.1 22.3 34.5 -ENSG00000133703 KRAS TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 1.6 2.6 1.7 3.6 -ENSG00000196233 LCOR FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.1 0.4 0.5 3.4 -ENSG00000189308 LIN54 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.9 0.9 2.1 -ENSG00000227507 LTB TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 11.3 9.8 NA 8.5 -ENSG00000254087 LYN TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 5.6 1.3 1.7 -ENSG00000102158 MAGT1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 1.7 1.9 3 -ENSG00000169032 MAP2K1 TRUE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 0.7 2.1 2.2 3.2 -ENSG00000071054 MAP4K4 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 1.3 2.1 2.1 -ENSG00000116141 MARK1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 1.3 1.9 -ENSG00000143384 MCL1 FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2 3.4 4.7 3.6 -ENSG00000085276 MECOM FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 3.4 2.1 4 -ENSG00000213999 MEF2B TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 12 5.6 5.9 9.1 -ENSG00000081189 MEF2C TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.2 3 1.7 1.9 -ENSG00000105976 MET FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 2.6 1.7 3.8 -ENSG00000174197 MGA FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 4.5 3.4 4.7 7.2 -ENSG00000197629 MPEG1 FALSE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8 10.7 5.8 9.1 -ENSG00000156738 MS4A1 FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 32589730 FALSE TRUE NA NA NA 1.8 0.4 1.3 1.5 -ENSG00000095002 MSH2 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 0.4 1.5 0.9 -ENSG00000116062 MSH6 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.6 2.6 2.6 -ENSG00000198793 MTOR FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.1 2.1 2.4 4 -ENSG00000118513 MYB FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 0.9 1.1 2.1 -ENSG00000136997 MYC FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.9 6.4 6.2 5.3 -ENSG00000172936 MYD88 TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 21179087 NA NA 12.9 21.4 15.2 26.4 -ENSG00000036448 MYOM2 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.6 4.3 3.2 8.1 -ENSG00000111704 NANOG TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 0.4 0.4 0.2 -ENSG00000134369 NAV1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 1.3 2 2.8 -ENSG00000141027 NCOR1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.1 2.7 4.5 -ENSG00000196498 NCOR2 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 4.3 3.6 5.7 -ENSG00000196712 NF1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.5 2.1 2.5 4 -ENSG00000109320 NFKB1 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 3.4 1.6 1.3 -ENSG00000077150 NFKB2 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.6 1.4 1.5 -ENSG00000100906 NFKBIA TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 4.7 3.6 3.8 -ENSG00000146232 NFKBIE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 26647218 NA NA 2.3 3.4 2.9 5.7 -ENSG00000144802 NFKBIZ FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 30275490 FALSE TRUE NA NA TRUE 1.8 0.9 1.5 1.3 -ENSG00000140853 NLRC5 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.9 3 3.7 8.3 -ENSG00000179709 NLRP8 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.5 3.4 2.1 3.4 -ENSG00000162408 NOL9 FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.7 2.1 1.3 6.8 -ENSG00000148400 NOTCH1 FALSE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.5 3 3.4 8.9 -ENSG00000134250 NOTCH2 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8 7.3 3.7 11.3 -ENSG00000144645 OSBPL10 FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 8.8 2.6 2.3 14.3 -ENSG00000182162 P2RY8 FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 22343534 TRUE FALSE 22343534 NA NA 7.2 6 NA 7.2 -ENSG00000196092 PAX5 FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 4.5 3.4 1.9 3.2 -ENSG00000169564 PCBP1 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.6 1.7 2.4 2.3 -ENSG00000186472 PCLO FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 22343534 FALSE FALSE 22343534 NA NA 15.3 23.1 15.1 21.3 -ENSG00000178104 PDE4DIP TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 8.5 5.3 2.3 -ENSG00000156531 PHF6 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.3 0.9 1.4 1.5 -ENSG00000171608 PIK3CD FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 2.1 2.5 4.9 -ENSG00000145675 PIK3R1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 2 4.7 2 2.1 -ENSG00000137193 PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 18.5 23.9 19.1 27.7 -ENSG00000102096 PIM2 FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.9 3.8 4 6.4 -ENSG00000110777 POU2AF1 TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5 5.6 3.3 2.3 -ENSG00000028277 POU2F2 TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.2 6.4 3.4 6.4 -ENSG00000108819 PPP1R9B FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.5 1.7 0.7 3.4 -ENSG00000057657 PRDM1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 8.1 8.5 5.4 10.2 -ENSG00000166501 PRKCB TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.3 3.4 1.6 5.1 -ENSG00000253729 PRKDC FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.9 6.4 6.6 7.7 -ENSG00000147224 PRPS1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.9 0.9 0.2 0.6 -ENSG00000171862 PTEN TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.1 4.3 -ENSG00000111679 PTPN6 TRUE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.7 5.1 2.9 4.5 -ENSG00000153707 PTPRD FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.7 5.6 5.2 7.7 -ENSG00000273993 PTPRK FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.1 6.4 3.3 3.6 -ENSG00000172613 RAD9A TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 1.7 0.5 0.4 -ENSG00000131759 RARA FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 0.4 0.7 4 -ENSG00000139687 RB1 FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.6 3.8 1.6 3.2 -ENSG00000181827 RFX7 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.4 1.9 -ENSG00000133111 RFXAP FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.1 NA 0.6 1.3 -ENSG00000067560 RHOA TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 11460166 NA NA 3.2 5.1 3.3 3.6 -ENSG00000116954 RRAGC FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 26691987 NA NA 1.8 0.4 2 3 -ENSG00000159216 RUNX1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 0.5 0.9 -ENSG00000267534 S1PR2 FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.1 2.6 2.2 2.1 -ENSG00000139718 SETD1B FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.6 NA 5.8 12.8 -ENSG00000181555 SETD2 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.7 0.4 4.6 6.4 -ENSG00000168137 SETD5 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.5 2.1 3.2 5.3 -ENSG00000115524 SF3B1 TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 3 2 2.1 -ENSG00000118515 SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.7 12.8 11.2 10.6 -ENSG00000169375 SIN3A TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.9 3.8 3 2.8 -ENSG00000127616 SMARCA4 FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 2.7 2.1 3.3 3 -ENSG00000100796 SMEK1 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 3 0.9 NA -ENSG00000185338 SOCS1 FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 16.5 4.7 10.4 12.8 -ENSG00000065526 SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.4 9.8 7.4 10 -ENSG00000168610 STAT3 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 24837465 NA NA 7.4 7.3 3.6 9.4 -ENSG00000173757 STAT5B FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 0.5 0.4 1.6 0.4 -ENSG00000166888 STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.5 4.7 3.8 2.6 -ENSG00000165025 SYK FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 0.4 0.8 2.3 -ENSG00000147133 TAF1 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5.4 3.8 4 4.9 -ENSG00000177565 TBL1XR1 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 8.8 8.1 5.7 12.8 -ENSG00000100721 TCL1A FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 2 3 2.8 3.8 -ENSG00000168769 TET2 FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.3 6 7.4 11.7 -ENSG00000163513 TGFBR2 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.3 1.3 1.9 1.9 -ENSG00000163659 TIPARP FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA NA 0.9 1.3 -ENSG00000137462 TLR2 TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 29713087 NA NA 2.7 3 1.5 2.8 -ENSG00000112697 TMEM30A TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5 5.6 2.8 7.7 -ENSG00000205542 TMSB4X TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28327945 NA NA 14.4 18.4 13.1 18.1 -ENSG00000118503 TNFAIP3 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 19412164 NA NA 6.1 12.4 8.1 16.6 -ENSG00000157873 TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 20884631 NA NA 14.2 12.8 9.7 16.8 -ENSG00000198846 TOX TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.5 5.1 4 5.5 -ENSG00000141510 TP53 TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 21.9 21.4 10.9 22.3 -ENSG00000131323 TRAF3 FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 25468570 FALSE FALSE NA NA NA 0.9 0.4 0.9 1.5 -ENSG00000153827 TRIP12 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 3 3.2 6 -ENSG00000196367 TRRAP FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 6 3.5 8.9 -ENSG00000077721 UBE2A TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.4 4.7 3.9 7 -ENSG00000104517 UBR5 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 5.1 3.2 5.5 -ENSG00000182168 UNC5C FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.6 2.6 2.2 5.1 -ENSG00000156687 UNC5D FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.4 2.6 1.8 1.9 -ENSG00000187555 USP7 FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.6 3.8 1.1 3.2 -ENSG00000132549 VPS13B FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.1 4.3 5.7 8.3 -ENSG00000095787 WAC FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.8 1.3 1.2 3.4 -ENSG00000166483 WEE1 FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.8 1.7 1.6 2.8 -ENSG00000100219 XBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.1 NA 1.6 1.3 -ENSG00000082898 XPO1 TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 3.2 1.3 1.4 2.3 -ENSG00000100811 YY1 TRUE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 3.8 1.1 4.3 -ENSG00000178951 ZBTB7A FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 1.7 1.3 1.5 -ENSG00000163874 ZC3H12A TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.1 6 -ENSG00000169554 ZEB2 TRUE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 6 3.7 6.8 -ENSG00000066827 ZFAT FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.6 2.7 2.8 -ENSG00000185650 ZFP36L1 TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.6 8.1 5.6 8.5 -ENSG00000005889 ZFX FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 1.4 1.7 -ENSG00000188994 ZNF292 FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5.2 6 4.3 6.4 -ENSG00000102935 ZNF423 TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.8 3.4 2.1 3.4 -ENSG00000168916 ZNF608 FALSE TRUE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 6.3 7.7 8.1 9.4 -ENSG00000177602 GSG2 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 HASPIN NA 0.7 2.1 1.5 4 -ENSG00000160683 CXCR5 FALSE FALSE FALSE TRUE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 2.5 1.7 2.1 4 -ENSG00000179399 GPC5 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.8 0.9 2.2 1.9 -ENSG00000275410 HNF1B FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.2 0.9 0.3 2.6 -ENSG00000162413 KLHL21 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 4.3 0.9 2.5 4.7 -ENSG00000130702 LAMA5 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.2 5.6 4.7 12.1 -ENSG00000086967 MYBPC2 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.9 1.7 2.8 3.4 -ENSG00000115421 PAPOLG FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.2 1.3 1.2 0.9 -ENSG00000168394 TAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5 2.6 NA 3.6 +ensembl_gene_id Gene Chapuy Reddy LymphGen Hubschmann curated other_support Lacy aSHM earliest_support common_alias noncoding_driver_suspect GAMBL dlbcl_chapuy dlbcl_reddy dlbcl_schmitz +ENSG00000075624 ACTB TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 22343534 NA NA 8.6 12.4 6.3 9.8 + ADAMTS1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000132466 ANKRD17 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.9 2.1 3.8 4.3 + ANKRD12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 + ACTG1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE Arthur FALSE TRUE 33953289 +ENSG00000117713 ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 8.4 4.3 4.4 8.9 +ENSG00000049618 ARID1B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5 2.1 3.3 6 +ENSG00000150347 ARID5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.6 2.6 4.3 4.3 +ENSG00000149311 ATM FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 5.2 4.7 5.9 5.5 +ENSG00000175054 ATR FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.5 3.8 2.8 4.9 +ENSG00000166710 B2M TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 14 12 12.1 15.5 +ENSG00000142867 BCL10 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 6.4 3.1 7.7 +ENSG00000119866 BCL11A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.6 3.4 1.6 4.5 +ENSG00000171791 BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 22.1 15.8 12.9 10.6 +ENSG00000113916 BCL6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 13.3 5.1 6.4 9.8 +ENSG00000110987 BCL7A FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 8.8 6.4 8.4 10.6 +ENSG00000183337 BCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE Unpublished TRUE FALSE NA NA NA 2.9 2.6 2.5 7.7 +ENSG00000186716 BCR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE possibly_aSHM_only FALSE FALSE NA NA NA 4.5 4.3 3.9 6.4 +ENSG00000115760 BIRC6 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE PMID: 32961552 FALSE FALSE 28985567 NA NA 6.3 4.7 6.4 10 +ENSG00000157764 BRAF TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.5 5.6 2 3.4 +ENSG00000162670 BRINP3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 FAM5C NA 2.7 3 3.3 3.4 +ENSG00000132640 BTBD3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 0.9 1.8 1.9 +ENSG00000133639 BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 9.7 14.5 7.5 14.5 +ENSG00000159388 BTG2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 14 6 9.2 17.2 +ENSG00000010671 BTK FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.4 2.1 3.1 3.6 + CADPS2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000198286 CARD11 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.9 8.1 7.8 15.3 +ENSG00000064012 CASP8 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.7 1.3 1.2 1.1 +ENSG00000114423 CBLB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 1.7 1.6 2.8 +ENSG00000129277 CCL4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 1.3 0.6 1.5 +ENSG00000112576 CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 6.8 4.7 3.8 9.8 +ENSG00000012124 CD22 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 3 2.8 1.7 +ENSG00000120217 CD274 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 21796119 NA NA 0.5 2.6 1.3 2.3 +ENSG00000135218 CD36 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.5 3 2.8 4.9 +ENSG00000116815 CD58 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 8.4 6.8 2.8 10 +ENSG00000125726 CD70 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5.6 7.7 6.9 9.4 +ENSG00000007312 CD79B TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.5 15.4 8.3 14.9 +ENSG00000112149 CD83 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 4.5 7.3 5.8 5.7 +ENSG00000134371 CDC73 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 1.3 0.7 0.6 +ENSG00000147889 CDKN2A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 2.9 1.7 1 6 +ENSG00000153922 CHD1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.1 2.9 3 +ENSG00000100888 CHD8 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 3 2.9 3.6 + CNOT2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000175040 CHST2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 0.4 0.7 2.3 +ENSG00000179583 CIITA TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 2.5 4.3 4.3 6.6 +ENSG00000167186 COQ7 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 0.4 0.5 0.6 +ENSG00000005339 CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 21.4 16.7 12.1 17.9 +ENSG00000213145 CRIP1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 3 0.7 1.9 +ENSG00000121966 CXCR4 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23131835 NA NA 2.7 2.6 1.5 2.6 +ENSG00000160683 CXCR5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 2.5 1.7 2.1 4 +ENSG00000071626 DAZAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 0.4 1.6 5.3 +ENSG00000143164 DCAF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 1.3 1.3 2.3 +ENSG00000178105 DDX10 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 1.7 0.8 1.5 +ENSG00000215301 DDX3X FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 29641966 NA NA 8.6 5.6 4.5 4.7 + DHX16 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000100697 DICER1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.6 1.1 2.3 +ENSG00000119772 DNMT3A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 0.7 1.3 1.4 2.1 + DNM2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000150760 DOCK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.8 6 4.9 10.2 +ENSG00000135144 DTX1 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 10.2 11.5 5.9 13.6 +ENSG00000158050 DUSP2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 9.3 4.3 9.7 12.6 +ENSG00000164330 EBF1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23174882 NA NA 8.8 12.8 8.8 10.9 +ENSG00000156508 EEF1A1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33945543 NA NA 4.1 4.7 2.5 3 +ENSG00000100393 EP300 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 9.5 8.1 7.1 9.8 +ENSG00000134954 ETS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 21796119 NA NA 5.4 5.6 4.4 7.9 +ENSG00000139083 ETV6 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.6 10.3 5.8 10.4 +ENSG00000106462 EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 20081860 NA NA 12.2 5.6 8.9 9.1 +ENSG00000026103 FAS TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 8.8 9 4.7 10.9 +ENSG00000138081 FBXO11 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL TRUE FALSE NA NA NA 4.1 2.6 2.1 2.1 +ENSG00000109670 FBXW7 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 1.7 1.3 3 +ENSG00000054598 FOXC1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.7 0.9 1.2 4.5 +ENSG00000150907 FOXO1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 10.6 2.1 2.4 7.2 +ENSG00000114861 FOXP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 0.7 3 2.1 1.9 +ENSG00000162613 FUBP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 0.9 1.5 1.5 +ENSG00000130383 FUT5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.2 1.3 0.3 1.3 +ENSG00000151834 GABRA2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.9 1.3 1.2 2.6 + GAK FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000120063 GNA13 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.7 10.3 11.9 8.5 +ENSG00000114353 GNAI2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.7 3.8 1.9 6.4 +ENSG00000087460 GNAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2 1.3 1.9 3.2 +ENSG00000066455 GOLGA5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 1.3 1.9 0.9 +ENSG00000179399 GPC5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.8 0.9 2.2 1.9 +ENSG00000177885 GRB2 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.4 3 1.5 2.8 +ENSG00000137106 GRHPR TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.7 4.7 3.6 4.5 +ENSG00000177602 GSG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 HASPIN NA 0.7 2.1 1.5 4 +ENSG00000184357 HIST1H1B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.3 9.8 7.3 8.5 +ENSG00000187837 HIST1H1C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.7 12.4 9.4 9.8 +ENSG00000124575 HIST1H1D TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.5 7.7 6.1 5.7 +ENSG00000168298 HIST1H1E TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 16.5 11.5 14.5 17.9 +ENSG00000180573 HIST1H2AC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.9 6.4 3.4 6.2 +ENSG00000233224 HIST1H2AM TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.1 6 4.8 5.7 +ENSG00000180596 HIST1H2BC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 28985567 NA NA 4.1 5.6 4.3 5.5 +ENSG00000197903 HIST1H2BK TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 5.4 5.6 4.2 4.9 +ENSG00000124693 HIST1H3B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 2 2.1 2 1.7 +ENSG00000184678 HIST2H2BE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.7 3 2.6 3.2 +ENSG00000206503 HLA-A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 8.8 9 0.2 11.1 +ENSG00000234745 HLA-B TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 9.5 10.7 1.2 16.4 +ENSG00000204525 HLA-C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.1 4.7 NA 5.5 +ENSG00000204257 HLA-DMA TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.5 1.7 NA 1.3 +ENSG00000242574 HLA-DMB FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.4 1.7 NA 5.1 + HLA-DQA1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000275410 HNF1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.2 0.9 0.3 2.6 +ENSG00000138668 HNRNPD FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.7 0.9 1.8 2.1 +ENSG00000169045 HNRNPH1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA TRUE 2 3.4 1.4 3.2 +ENSG00000153187 HNRNPU FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.8 3.4 2.4 3.4 +ENSG00000174775 HRAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA 0.4 0.7 0.2 +ENSG00000122986 HVCN1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.2 3.4 2.3 1.9 +ENSG00000117318 ID3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 2 0.9 3.5 4.7 +ENSG00000254709 IGLL5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 41.1 9 16.1 36 +ENSG00000104365 IKBKB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 3.4 1.1 3 + IKBKE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000161405 IKZF3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28479318 NA NA 4.3 4.3 3.9 4.5 +ENSG00000172349 IL16 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.3 5.1 2.8 3.8 +ENSG00000077238 IL4R FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 33684939 NA NA 2.5 3.8 2.5 2.1 +ENSG00000136244 IL6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.5 1.7 1.2 2.8 +ENSG00000128908 INO80 FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 3.4 2.5 4.3 + IRF1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000137265 IRF4 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 3.2 2.1 4.4 7 +ENSG00000140968 IRF8 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 8.8 10.3 7.6 10.4 +ENSG00000143772 ITPKB FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 6.5 9.4 6.7 6.8 +ENSG00000162434 JAK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 2.9 2.1 2.2 1.9 +ENSG00000105639 JAK3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 1.4 NA 1 1.3 +ENSG00000171223 JUNB FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.9 2.1 3.5 3.2 +ENSG00000176407 KCMF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.1 1 1.5 +ENSG00000127528 KLF2 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 7.7 3 2.1 7 +ENSG00000197705 KLHL14 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5 7.3 4.6 6.6 +ENSG00000162413 KLHL21 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 4.3 0.9 2.5 4.7 +ENSG00000172578 KLHL6 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 5.2 9 6.4 9.1 +ENSG00000055609 KMT2C FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 MLL3 NA 2.9 6.4 7.3 8.3 +ENSG00000167548 KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 MLL2 NA 31.4 26.1 22.3 34.5 +ENSG00000133703 KRAS TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 1.6 2.6 1.7 3.6 +ENSG00000130702 LAMA5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.2 5.6 4.7 12.1 + LRP12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000196233 LCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.1 0.4 0.5 3.4 +ENSG00000189308 LIN54 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.9 0.9 2.1 +ENSG00000227507 LTB TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 11.3 9.8 NA 8.5 +ENSG00000254087 LYN TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 5.6 1.3 1.7 +ENSG00000102158 MAGT1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 1.7 1.9 3 +ENSG00000169032 MAP2K1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 0.7 2.1 2.2 3.2 +ENSG00000071054 MAP4K4 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 1.3 2.1 2.1 +ENSG00000116141 MARK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 1.3 1.9 +ENSG00000143384 MCL1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2 3.4 4.7 3.6 +ENSG00000085276 MECOM FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.6 3.4 2.1 4 +ENSG00000213999 MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 12 5.6 5.9 9.1 +ENSG00000081189 MEF2C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.2 3 1.7 1.9 +ENSG00000105976 MET FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 2.6 1.7 3.8 +ENSG00000174197 MGA FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 4.5 3.4 4.7 7.2 +ENSG00000197629 MPEG1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8 10.7 5.8 9.1 +ENSG00000156738 MS4A1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 32589730 FALSE TRUE NA NA NA 1.8 0.4 1.3 1.5 +ENSG00000095002 MSH2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 0.4 1.5 0.9 +ENSG00000116062 MSH6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.6 2.6 2.6 +ENSG00000198793 MTOR FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.1 2.1 2.4 4 +ENSG00000118513 MYB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7 0.9 1.1 2.1 +ENSG00000086967 MYBPC2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.9 1.7 2.8 3.4 +ENSG00000136997 MYC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.9 6.4 6.2 5.3 +ENSG00000172936 MYD88 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 21179087 NA NA 12.9 21.4 15.2 26.4 +ENSG00000036448 MYOM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.6 4.3 3.2 8.1 +ENSG00000111704 NANOG TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 0.4 0.4 0.2 +ENSG00000134369 NAV1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 1.3 2 2.8 +ENSG00000141027 NCOR1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.1 2.7 4.5 +ENSG00000196498 NCOR2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 4.3 3.6 5.7 +ENSG00000196712 NF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.5 2.1 2.5 4 +ENSG00000109320 NFKB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2 3.4 1.6 1.3 +ENSG00000077150 NFKB2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 2.6 1.4 1.5 +ENSG00000100906 NFKBIA TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 4.7 3.6 3.8 +ENSG00000146232 NFKBIE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26647218 NA NA 2.3 3.4 2.9 5.7 +ENSG00000144802 NFKBIZ FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 30275490 FALSE TRUE NA NA TRUE 1.8 0.9 1.5 1.3 +ENSG00000140853 NLRC5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.9 3 3.7 8.3 +ENSG00000179709 NLRP8 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.5 3.4 2.1 3.4 +ENSG00000162408 NOL9 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.7 2.1 1.3 6.8 +ENSG00000148400 NOTCH1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.5 3 3.4 8.9 +ENSG00000134250 NOTCH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8 7.3 3.7 11.3 + N2RF2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000144645 OSBPL10 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 8.8 2.6 2.3 14.3 +ENSG00000182162 P2RY8 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 22343534 TRUE FALSE 22343534 NA NA 7.2 6 NA 7.2 +ENSG00000115421 PAPOLG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.2 1.3 1.2 0.9 +ENSG00000196092 PAX5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 4.5 3.4 1.9 3.2 +ENSG00000169564 PCBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.6 1.7 2.4 2.3 +ENSG00000186472 PCLO FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 22343534 FALSE FALSE 22343534 NA NA 15.3 23.1 15.1 21.3 +ENSG00000178104 PDE4DIP TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 8.5 5.3 2.3 +ENSG00000156531 PHF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.3 0.9 1.4 1.5 +ENSG00000171608 PIK3CD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.1 2.1 2.5 4.9 +ENSG00000145675 PIK3R1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 2 4.7 2 2.1 +ENSG00000137193 PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 18.5 23.9 19.1 27.7 +ENSG00000102096 PIM2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.9 3.8 4 6.4 +ENSG00000110777 POU2AF1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5 5.6 3.3 2.3 +ENSG00000028277 POU2F2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.2 6.4 3.4 6.4 + PNPO FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000108819 PPP1R9B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.5 1.7 0.7 3.4 +ENSG00000057657 PRDM1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 8.1 8.5 5.4 10.2 +ENSG00000166501 PRKCB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.3 3.4 1.6 5.1 +ENSG00000253729 PRKDC FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.9 6.4 6.6 7.7 +ENSG00000147224 PRPS1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.9 0.9 0.2 0.6 +ENSG00000171862 PTEN TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.1 4.3 +ENSG00000111679 PTPN6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.7 5.1 2.9 4.5 +ENSG00000153707 PTPRD FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.7 5.6 5.2 7.7 +ENSG00000273993 PTPRK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.1 6.4 3.3 3.6 + RAC2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000172613 RAD9A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 1.7 0.5 0.4 +ENSG00000131759 RARA FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 0.4 0.7 4 +ENSG00000139687 RB1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.6 3.8 1.6 3.2 +ENSG00000181827 RFX7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.4 1.9 +ENSG00000133111 RFXAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.1 NA 0.6 1.3 +ENSG00000067560 RHOA TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 11460166 NA NA 3.2 5.1 3.3 3.6 +ENSG00000116954 RRAGC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 26691987 NA NA 1.8 0.4 2 3 +ENSG00000159216 RUNX1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 0.5 0.9 +ENSG00000267534 S1PR2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.1 2.6 2.2 2.1 +ENSG00000139718 SETD1B FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.6 NA 5.8 12.8 +ENSG00000181555 SETD2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.7 0.4 4.6 6.4 +ENSG00000168137 SETD5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.5 2.1 3.2 5.3 +ENSG00000115524 SF3B1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2 3 2 2.1 +ENSG00000118515 SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.7 12.8 11.2 10.6 +ENSG00000169375 SIN3A TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.9 3.8 3 2.8 + SIAH2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 + SLC34A2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000127616 SMARCA4 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 2.7 2.1 3.3 3 +ENSG00000100796 SMEK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2 3 0.9 NA +ENSG00000185338 SOCS1 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 16.5 4.7 10.4 12.8 +ENSG00000065526 SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.4 9.8 7.4 10 +ENSG00000168610 STAT3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 24837465 NA NA 7.4 7.3 3.6 9.4 +ENSG00000173757 STAT5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 0.5 0.4 1.6 0.4 +ENSG00000166888 STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.5 4.7 3.8 2.6 +ENSG00000165025 SYK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 0.4 0.8 2.3 +ENSG00000147133 TAF1 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5.4 3.8 4 4.9 +ENSG00000168394 TAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5 2.6 NA 3.6 +ENSG00000177565 TBL1XR1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 8.8 8.1 5.7 12.8 +ENSG00000100721 TCL1A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 2 3 2.8 3.8 +ENSG00000168769 TET2 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.3 6 7.4 11.7 +ENSG00000163513 TGFBR2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.3 1.3 1.9 1.9 +ENSG00000163659 TIPARP FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA NA 0.9 1.3 +ENSG00000137462 TLR2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 29713087 NA NA 2.7 3 1.5 2.8 +ENSG00000112697 TMEM30A TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5 5.6 2.8 7.7 +ENSG00000205542 TMSB4X TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28327945 NA NA 14.4 18.4 13.1 18.1 +ENSG00000118503 TNFAIP3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 19412164 NA NA 6.1 12.4 8.1 16.6 +ENSG00000157873 TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 20884631 NA NA 14.2 12.8 9.7 16.8 +ENSG00000198846 TOX TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.5 5.1 4 5.5 +ENSG00000141510 TP53 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 21.9 21.4 10.9 22.3 +ENSG00000131323 TRAF3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 25468570 FALSE FALSE NA NA NA 0.9 0.4 0.9 1.5 + TRAF6 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000153827 TRIP12 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 3 3.2 6 +ENSG00000196367 TRRAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2 6 3.5 8.9 +ENSG00000077721 UBE2A TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.4 4.7 3.9 7 +ENSG00000104517 UBR5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 5.1 3.2 5.5 +ENSG00000182168 UNC5C FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.6 2.6 2.2 5.1 + UNC5B FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000156687 UNC5D FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.4 2.6 1.8 1.9 +ENSG00000187555 USP7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.6 3.8 1.1 3.2 +ENSG00000132549 VPS13B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.1 4.3 5.7 8.3 +ENSG00000095787 WAC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.8 1.3 1.2 3.4 + WNK1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 +ENSG00000166483 WEE1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.8 1.7 1.6 2.8 +ENSG00000100219 XBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.1 NA 1.6 1.3 +ENSG00000082898 XPO1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 3.2 1.3 1.4 2.3 +ENSG00000100811 YY1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.1 3.8 1.1 4.3 +ENSG00000178951 ZBTB7A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.8 1.7 1.3 1.5 +ENSG00000163874 ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.2 4.7 3.1 6 +ENSG00000169554 ZEB2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.4 6 3.7 6.8 +ENSG00000066827 ZFAT FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9 2.6 2.7 2.8 +ENSG00000185650 ZFP36L1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.6 8.1 5.6 8.5 +ENSG00000005889 ZFX FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5 0.4 1.4 1.7 +ENSG00000188994 ZNF292 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5.2 6 4.3 6.4 +ENSG00000102935 ZNF423 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.8 3.4 2.1 3.4 +ENSG00000168916 ZNF608 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 6.3 7.7 8.1 9.4 + ZNF217 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 diff --git a/resources/curated/fl_genes.tsv b/resources/curated/fl_genes.tsv index 15b13d72..f874904f 100644 --- a/resources/curated/fl_genes.tsv +++ b/resources/curated/fl_genes.tsv @@ -1,99 +1,116 @@ -gene curated Dreval Crouch de_Leval Kalmbach Russler-Germain First_description frequency_GAMBL Comment -ABL2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0.6928406466512702 NA -ACTB TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 5.311778290993072 aSHM -ARID1A TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE NA 12.471131639722863 NA -ATP6AP1 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 4.849884526558891 NA -ATP6V1B2 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 7.390300230946882 NA -B2M TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 8.545034642032332 NA -BCL10 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 2.3094688221709005 NA -BCL2 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 50.34642032332564 NA -BCL6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37084389 5.773672055427252 aSHM -BCL7A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 13.856812933025404 aSHM -BIRC6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.695150115473441 NA -BTG1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE NA 6.466512702078522 aSHM -BTG2 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE 21796119 4.387990762124711 aSHM -BTK TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.928406466512702 NA -CARD11 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 14.780600461893764 NA -CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 3.233256351039261 NA -CD70 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA -CD79B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 2.771362586605081 NA -CD83 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE 37493986 1.8475750577367205 aSHM -CILP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.4618937644341801 NA -CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 65.1270207852194 NA -CTSS TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 3.9260969976905313 NA -CYP2A6 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.23094688221709006 NA -DDX3X FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 37084389 2.540415704387991 NA -DTX1 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 5.542725173210162 NA -DUSP2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA -EBF1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 8.545034642032332 NA -EP300 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE 21796119 12.471131639722863 NA -EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 20081860 24.942263279445726 NA -FAS TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 5.080831408775982 NA -FOXO1 TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 12.933025404157044 NA -GBP7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0.23094688221709006 NA -GNA13 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 10.161662817551964 NA -GNAI2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 4.157043879907621 NA -GRM6 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA -HIST1H1B TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 5.542725173210162 aSHM -HIST1H1C TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE 21796119 5.080831408775982 aSHM -HIST1H1D TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 3.233256351039261 aSHM -HIST1H1E TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 12.933025404157044 aSHM -HIST1H2AC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 2.0785219399538106 aSHM -HIST1H2AG TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 2.0785219399538106 aSHM -HIST1H2AM TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 3.695150115473441 aSHM -HIST1H2BC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 3.464203233256351 aSHM -HIST1H2BD TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 1.1547344110854503 aSHM -HIST1H2BG TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 2.0785219399538106 aSHM -HIST1H2BM FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.6928406466512702 aSHM -HIST1H3B TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 1.6166281755196306 aSHM -HIST1H3G TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 1.6166281755196306 aSHM -HIST1H3I FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 aSHM -HLA-B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.464203233256351 NA -HNRNPD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 0 NA -HVCN1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.466512702078522 NA -ID3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA -IGLL5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 35.33487297921478 aSHM/SHM. Unclear if this should be considered a gene -IRF4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 1.1547344110854503 LBCL-IRF4 -IRF8 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE 21796119 12.009237875288683 aSHM -ITPKB TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.233256351039261 NA -KIR3DL1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 1.1547344110854503 NA -KLF2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA -KLHL6 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 7.159353348729792 NA -KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 67.6674364896074 NA -LTB TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 8.775981524249422 NA -MAGEC1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 1.8475750577367205 NA -MAP2K1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 27325104 1.3856812933025404 PTNFL -MAP7D1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0 NA -MEF2B TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 12.933025404157044 NA -MEF2C TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.235565819861431 NA -MKI67 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA -MYC FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 0.9237875288683602 NA -MYD88 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 1.8475750577367205 NA -NFKBIA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.6928406466512702 NA -OR8H2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA -P2RY8 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA -PCLO TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 9.237875288683602 NA -PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 9.237875288683602 NA -POU2AF1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 12.240184757505773 NA -POU2F2 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE NA 6.235565819861431 NA -PTPRD TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.695150115473441 NA -PZP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA -RRAGC TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 10.854503464203233 NA -S1PR2 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.235565819861431 NA -SESN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 28659443 0.23094688221709006 NA -SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 6.0046189376443415 NA -SHROOM3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA -SMARCA4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 4.157043879907621 NA -SOCS1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 9.699769053117782 NA -SRRM2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.3856812933025404 NA -STAB2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 2.540415704387991 NA -STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE NA 15.935334872979215 NA -TBL1XR1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 3.9260969976905313 NA -TMEM30A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 0.9237875288683602 NA -TMSB4X TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 4.387990762124711 NA -TNFAIP3 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 4.849884526558891 NA -TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 40.415704387990765 NA -TP53 TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 6.928406466512702 NA -VMA21 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 5.080831408775982 NA -XIRP2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 3.9260969976905313 NA -ZC3H12A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 0.4618937644341801 NA +gene curated Dreval Hubschmann Crouch de_Leval Kalmbach Russler-Germain First_description frequency_GAMBL Comment +ABL2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0.6928406466512702 NA +ACTB TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 5.311778290993072 aSHM +ACTG1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +ARID1A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE NA 12.471131639722863 NA +ATP6AP1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 4.849884526558891 NA +ATP6V1A FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +ATP6V1B2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 7.390300230946882 NA +B2M TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 8.545034642032332 NA +BCL10 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 2.3094688221709005 NA +BCL2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 50.34642032332564 NA +BCL6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37084389 5.773672055427252 aSHM +BCL7A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA 13.856812933025404 aSHM +BIRC6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.695150115473441 NA +BTG1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE FALSE NA 6.466512702078522 aSHM +BTG2 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE 21796119 4.387990762124711 aSHM +BTK TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.928406466512702 NA +CARD11 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 14.780600461893764 NA +CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 3.233256351039261 NA +CCDC42BPB FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +CD70 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA +CD79B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 2.771362586605081 NA +CD83 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE 37493986 1.8475750577367205 aSHM +CILP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.4618937644341801 NA +CPNE8 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 65.1270207852194 NA +CTSS TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 3.9260969976905313 NA +CXCR4 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +CYP2A6 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.23094688221709006 NA +DDX3X FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 37084389 2.540415704387991 NA +DTX1 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 5.542725173210162 NA +DUSP2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA +DHX15 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +EBF1 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 8.545034642032332 NA +EEF1A1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +EP300 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE 21796119 12.471131639722863 NA +EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 20081860 24.942263279445726 NA +FAS TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 5.080831408775982 NA +FOXO1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 12.933025404157044 NA +FZR1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +GBP7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0.23094688221709006 NA +GNA13 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 10.161662817551964 NA +GNAI2 TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 4.157043879907621 NA +GRM6 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA +HIST1H1B TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 5.542725173210162 aSHM +HIST1H1C TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE 21796119 5.080831408775982 aSHM +HIST1H1D TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 3.233256351039261 aSHM +HIST1H1E TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 12.933025404157044 aSHM +HIST1H2AC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 2.0785219399538106 aSHM +HIST1H2AG TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 2.0785219399538106 aSHM +HIST1H2AM TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 3.695150115473441 aSHM +HIST1H2BC TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 3.464203233256351 aSHM +HIST1H2BD TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 1.1547344110854503 aSHM +HIST1H2BG TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 2.0785219399538106 aSHM +HIST1H2BM FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.6928406466512702 aSHM +HIST1H3B TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 1.6166281755196306 aSHM +HIST1H3G TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA 1.6166281755196306 aSHM +HIST1H3I FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 aSHM +HLA-B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.464203233256351 NA +HNRNPD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 0 NA +HVCN1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.466512702078522 NA +ID3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA +IGLL5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 35.33487297921478 aSHM/SHM. Unclear if this should be considered a gene +IRF4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 1.1547344110854503 LBCL-IRF4 +IRF8 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE 21796119 12.009237875288683 aSHM +ITPKB TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.233256351039261 NA +JUP FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +KIR3DL1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 1.1547344110854503 NA +KLF2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA +KLHL6 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 7.159353348729792 NA +KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 67.6674364896074 NA +LAPTM5 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +LTB TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 8.775981524249422 NA +MAGEC1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 1.8475750577367205 NA +MAP2K1 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 27325104 1.3856812933025404 PTNFL +MAP7D1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE 37563306 0 NA +MEF2B TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 12.933025404157044 NA +MEF2C TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.235565819861431 NA +MGEA5 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +MKI67 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA +MYC FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA 0.9237875288683602 NA +MYCBP2 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +MYD88 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 1.8475750577367205 NA +NFKBIA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.6928406466512702 NA +OR8H2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA +P2RY8 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 2.3094688221709005 NA +PDS5B FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +PCLO TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 9.237875288683602 NA +PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 9.237875288683602 NA +POU2AF1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA 12.240184757505773 NA +POU2F2 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE NA 6.235565819861431 NA +PPP4C FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +PTPRD TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 3.695150115473441 NA +PRKDC FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +PZP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 0.9237875288683602 NA +RRAGC TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 10.854503464203233 NA +RBM6 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +S1PR2 TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA 6.235565819861431 NA +SESN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 28659443 0.23094688221709006 NA +SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE 21796119 6.0046189376443415 NA +SHROOM3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.1547344110854503 NA +SMARCA4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 4.157043879907621 NA +SOCS1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA 9.699769053117782 NA +SRRM2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 1.3856812933025404 NA +STAB2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 2.540415704387991 NA +STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE NA 15.935334872979215 NA +TBL1XR1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA 3.9260969976905313 NA +TMEM30A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 0.9237875288683602 NA +TMSB4X TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 4.387990762124711 NA +TNFAIP3 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 21796119 4.849884526558891 NA +TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 21796119 40.415704387990765 NA +TP53 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE 21796119 6.928406466512702 NA +VMA21 TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 5.080831408775982 NA +XIRP2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 37493986 3.9260969976905313 NA +TPP1 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE 33953289 +ZC3H12A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA 0.4618937644341801 NA