MPXV Erasmus: use ref with masked 3' ITR (190767 to 197205)

schemes/mpxv/erasmus/2500/v1.0.0/info.yml

@@ -13,4 +13,4 @@ citations:
 - https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-whole-genome-sequencing-using-comb-n2bvj6155lk5
 license: CC-BY-SA-4.0
 primer_checksum: primaschema:9acd3f5ce5711ed2
-reference_checksum: primaschema:31ff1b123bbce197
+reference_checksum: primaschema:17cbcde0cfff7158

schemes/mpxv/erasmus/2500/v1.0.0/reference.fasta

@@ -1,4 +1,4 @@
->ON563414.3
+>ON563414.3 masked_ITR_190767_197205
 TTTTAGTACATTAATATTATATTTTACTATTTTATTTAGTGTCTAGAAAAAAATGTGTGACCCACGACCG
 TAGGAAACTCTAGAGGGTAAGAAAAATCAATCGTTTATAGAGACCATCAGAAAGAGGTTTAATATTTTTG
 TGAGACCTATCGAAGAGAGAAAGGATAAAAACTTTTTACGACTCCATCAGAAAGAGGTTTAATATTTTTG
@@ -2724,97 +2724,96 @@ TCAATCTGAAAATAAATGGAAGTGATATAACTAATACAGCAGATATATTGCTGGACAATTATCCAATTAT
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-AGTAAACTCGTCGACAAAGCACTCAATAAATTAGAGTCTACCATCGATAGTCAATCTAGACTATCGTATT
-TGCCTCCGGAAATTATGCGCAATATCATAACCAAGCTAAGCGACTACCATCTAAACAGTATGTTGTACGG
-AAAGAACCATTACAAATATTATCCATGATAGAAAGAAAATATTTAAAAAATAATCTATATGATTGGAGAA
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-TATATTGTTTCTCTCATGTATAATAATAAACGGAAGAGATATAGCACCACATGCACCATCCAATGGAAAG
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-GATTATGTGATAGCAAGACTAATACACAATGTACACCGTGTGGTTCGGATACCTTTACATCTCACAATAA
-TCATTTACAGGCTTGTCTAAGTTGTAACGGAAGATGTGATAGTAATCAGGTAGAGACGCGATCGTGTAAC
-ACGACTCACAATAGAATCTGTGAATGCTCTCCAGGATATTATTGTCTTCTCAAAGGAGCATCAGGGTGTA
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-CATCTGTTCTCCGTGTGGTCCCGGAACATATTCTCACACCGTCTCTTCCACAGATAAATGCGAACCCGTC
-GTAACCAGCAATACATTTAACTATATCGATGTGGAAATTAACCTGTATCCAGTCAACGACACATCGTGTA
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-TCTAGTGGGCGACTGTCTATCTAGCGTCGACATCTACATACTATATAGTAATACCAATACTCAAGACTAC
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-ATATACATAAACTGATCACTAATTCCCAGAATCCCACCCACTTATAGTAAGTTTTTTTACCTATAAATAA
-TAAATACAATAATTAATTTCTCGTAAAAGTAGAAAATATATTCTAATTTATTATATGGTAAGAAAGTAGA
-ATCATCTAGAACAGTAATCAATCAATAGCAATCATGAAACAATATATTGTCCTGGCATGCATGTGCCTAG
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-ACGGATCGGCATCTGAAGGTGCAACCGATGATACTTCACTCATCGATTCAACAAAACTCAAAGCATGTGT
-CTGAATCGATAACTCTATTCATCTGAAAATGGATGAGTTGGGTTAATCGAACGATTCAGACACCGCACCA
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-TAGGGGACACTGCTCACGTTTTTTCTCTAGTACATAATTTCACACAAGTTTTTATACAGACAAATTAATT
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-CTCTAGAGTTTCCTACGGTCGTGGGTCACACATTTTTTTCTAGACACTAAATAAAATAGTAAAATATAAT
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