Компоненты относящиеся только к backend хранятся в директории backend/protected/components.
Компоненты относящиеся только к frontend хранятся в директории protected/components.
Компоненты ядра хранятся в папке protected/components/core.
Компоненты специфические для определенной тематики сайта должны хранится в protected/components/special. Дале идет директория названия тематики. Например есть компонент калькулятор калорий относящийся к тематике еда, то он должен располагаться в директории protected/components/special/food.
Компоненты относящиеся к модулям располагаются в директории модуля, например: protected/modules/review/components.