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飞桨nnUNet医学图像分割框架,一个基于PaddlePaddle翻译的nnUNet全新版本!

Build Status License python version support os PyPI Status

这是paddle-nnUNet

UNet可以说是卷积神经网络在医学图像分割领域的最为成功的模型。而作为一个自适应框架,nnUNet无疑是在所有UNet改进和优化模型中最出色的一个。nnUNet原本是基于Pytorch框架 开发的,这是对应的PaddlePaddle翻译版本。如果想了解nnU-Net更多的信息,请阅读作者发表的论文

安装方式

由于nnUNet采用动态图自动构建的,安装之前请确保飞桨框架版本大于2.0版本。同时,Python 2不受支持,请确保您使用的是 Python 3,安装方法有两种:

  • 用作标准化基线、开箱即用的分割算法或使用预训练模型运行推理

    pip install paddle-nnUNet
    
  • 用作集成框架(这将会创建nnU-Net代码的副本,以便根据需要对其进行修改):

    git clone https://github.com/szuboy/paddle-nnUNet.git
    cd padle-nnUNet
    python install -e .
    

请注意,这些命令只是执行Python脚本,如果是在虚拟环境中安装了nnU-Net,则在执行命令时必须激活此环境。

快速使用

数据转换

待补充

实验计划和预处理

待补充

模型的训练

待补充

详细的教程推荐

如果你还想了解更详细的教程解析,请参考ReadTheDocs教程 ,这里啥都有讲!可用性不够好?也请让我们知道!

许可证书

本项目的发布受Apache 2.0 license许可认证。