From 1cea725cca2a8f3edb45bac45d7983e255285d5e Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Yamato Matsuoka <yamaton@gmail.com>
Date: Sat, 23 Oct 2021 18:59:50 -0400
Subject: [PATCH] Edit README

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 README-ja.md | 2 +-
 README.md    | 2 +-
 2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/README-ja.md b/README-ja.md
index 0f88a16..d52b076 100644
--- a/README-ja.md
+++ b/README-ja.md
@@ -43,7 +43,7 @@ DDBJへの登録には指定された形式の[アノテーションファイル
 
 ## 出力の「正しさ」について
 
-DDBJアノテーション出力には幾多の守るべきルールはあるものの、正解には曖昧さが伴います。そのため当ツールではRefSeqの出すGFF3とGenBank形式の対応をもって「正解」と定義しています。これに基づいて、RefSeqのGenBank形式をできるだけシンプルにDDBJアノテーション形式に変換した正解例を、当ツールで作られるDDBJアノテーション出力とを比べることで評価をしています。[評価の詳細ページはこちら](https://github.com/yamaton/gff3toddbj/tree/main/evaluation)。
+DDBJアノテーション出力には幾多の守るべきルールはあるものの、正解には曖昧さが伴います。そのため当ツールではRefSeqの出すGFF3とGenBank形式の対応をもって「正解」と定義しています。（ただし指針がDDBJと異なるばあいにはDDBJのほうを優先しています。）これに基づいて、RefSeqのGenBank形式をできるだけシンプルにDDBJアノテーション形式に変換した正解例を、当ツールで作られるDDBJアノテーション出力とを比べることで評価をしています。[評価の詳細ページはこちら](https://github.com/yamaton/gff3toddbj/tree/main/evaluation)。
 
 なお評価の副産物としてのGenBankからDDBJアノテーションの変換ツール `genbank-to-ddbj` を同梱しています。良い品質のGenBank形式があるときにはGFF3から作るよりも有用かもしれません。
 
diff --git a/README.md b/README.md
index 3d86ae5..92f9c02 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -47,7 +47,7 @@ Please take a look at our [test directory](https://github.com/yamaton/gff3toddbj
 ## How accurate is the conversion?
 
 While there are many rules a DDBJ annotation file needs to comply with, it's difficult to tell what the correct GFF3→DDBJ conversion is.
-There is no example of full-fledged GFF3 → DDBJ conversion available, either. So, we define GFF3-GenBank correspondence in RefSeq as the "correct" examples. To evaluate GFF3-to-DDBJ, we use RefSeq data and compare `gff3-to-ddbj` output with the other DDBJ annotation from `genbank-to-ddbj` using the GenBank format. Please take a look at our evaluation dcoument for the detail as well as the current status. ([TODO] Add the page...)
+There is no examples of fully-functional GFF3 → DDBJ conversion, either. So, we define GFF3-GenBank correspondence in RefSeq as the "correct" examples. (We take the DDBJ side when instructions differ, though.) To evaluate GFF3-to-DDBJ, we use RefSeq data and compare `gff3-to-ddbj` output with the other DDBJ annotation from `genbank-to-ddbj` using the GenBank format. Please take a look at our evaluation dcoument for the detail as well as the current status. ([TODO] Add the page...)
 
 Here `genbank-to-ddbj` is an executable included in this package. It shares codebase with `gff3-to-ddbj`, but we believe it does not bring any complexity to our evaluation due to its much simpler internals.