Une nouvelle série de modèles se basant sur les 17 espèces d'arbres étudiées par Yan Boulanger et est comparée avec les cartes produites par Yan Boulanger (répartition de la biomasse par espèce).
| espèces étudiées | code espèce |
|---|---|
| "abies_balsamea" | ABIE.BAL |
| "acer_rubrum" | ACER.RUB |
| "acer_saccharum" | ACER.SAH |
| "betula_alleghaniensis" | BETU.ALL |
| "betula_papyrifera" | BETU.PAP |
| "fagus_grandifolia" | FAGU.GRA |
| "larix_laricina" | LARI.LAR |
| "picea_glauca" | PICE.GLA |
| "picea_mariana" | PICE.MAR |
| "picea_rubens" | PICE.RUB |
| "pinus_banksiana" | PINU.BAN |
| "pinus_resinosa" | PINU.RES |
| "pinus_strobus" | PINU.STR |
| "populus_tremuloides" | POPU.TRE |
| "quercus_rubra" | QUER.RUB |
| "tsuga_canadensis" | TSUG.CAN |
| "thuja_occidentalis" | THUJ.OCC |
Production d'un tableau de bord pour la comparaison des sorties de SDMs produits avec 6 algorithmes différents: INLA (auto-corrélation spatiale), MaxEnt, BRT, RT, mapSpecies.
Les modèles ont été développés et produits par les personnes suivantes:
- INLA : Vincent Bellavance (première version)
- MaxEnt : Claire-Cécile Juhasz
- RT, BRT, mapSpecies :François Rousseu
Pur chaque type d'algorithme, les modèles ont été produits avec 6 différentes combinaisons de paramétrages (excepté pour les modèles INLA) :
- Predictors - noBias - Spatial
- Predictors - noBias - noSpatial
- noPredictors - noBias - Spatial
- noPredictors - Bias - Spatial
- Predictors - Bias - Spatial
- Predictors - Bias - noSpatial
Predictors correspond à l'inclusion de variables environnementales comme prédicteurs. Bias correspond à l'utilisation d'un biais lors de la génération aléatoire des pseudo-absences (tirage dans toutes les occurrences du groupe taxonomique étudié). Spatial correspond à l'intégration d'un effet d'auto-corrélation spatiale via la création de 3 rasters présentant, pour chaque pixel, la valeur en x (raster 1), y (raster 2) et x*y (raster 3) du centre du pixel.
Une première version de ce tableau de bord a été produite pour 27 espèces appartenant à la liste des oiseaux nicheurs du Québec (cf ci-dessous) et se déploie en local (https://github.com/Sckende/BDQC_SDM_benchmark_initial). L'objectif de ce présent repo est de migrer le tableau de bord en remote.
| espèces étudiées |
|---|
| "bonasa_umbellus" |
| "catharus_bicknelli" |
| "catharus_fuscescens" |
| "catharus_guttatus" |
| "catharus_ustulatus" |
| "falcipennis_canadensis" |
| "junco_hyemalis" |
| "melospiza_georgiana" |
| "melospiza_lincolnii" |
| "melospiza_melodia" |
| "poecile_atricapillus" |
| "poecile_hudsonicus" |
| "setophaga_americana" |
| "setophaga_caerulescens" |
| "setophaga_castanea" |
| "setophaga_cerulea" |
| "setophaga_coronata" |
| "setophaga_fusca" |
| "setophaga_magnolia" |
| "setophaga_palmarum" |
| "setophaga_pensylvanica" |
| "setophaga_petechia" |
| "setophaga_pinus" |
| "setophaga_ruticilla" |
| "setophaga_striata" |
| "setophaga_tigrina" |
| "setophaga_virens" |