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para ver o código em python completo via colab:
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Para ver aqui no GitHib é só acessar o arquivo "Inferential analysis with data from NHANES.ipynb" (Caso de erro é só acessar o link do código no colab ou aperta F5)
O transtorno depressivo representa um grande problema de saúde pública e é apontado como uma das principais causas de doenças e debilitações segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS). A depressão resulta de uma interação complexa de fatores sociais, psicológicos e biológicos e, embora o acesso a diagnósticos e tratamentos esteja aumentando, muitos ainda não possuem acesso ao controle adequado dos sintomas depressivos.
Para garantir um estilo de vida saudável, a OMS recomenda a prática regular de exercícios, bem como a adoção de uma dieta saudável rica em alimentos in natura e com reduzido teor de gordura saturada, sal e açucares refinados.
Neste desafio, utilizaremos dados de uma pesquisa realizada anualmente nos Estados Unidos para avaliar (1) qual o perfil de indivíduos (adultos maiores de 18 anos) com sintomas depressivos nos EUA no período de 2005-2006, e (2) se hábitos saudáveis de alimentação e atividade física estão associados a menores índices de depressão nesta população.
O National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) é uma pesquisa anual conduzida pelo National Center for Health Statistics (NCHS) do Centro de Controle e Prevenção de Doenças (Centers for Disease Control - CDC) para avaliar a saúde e nutrição de adultos e crianças dos Estados Unidos. Dados coletados incluem questões demográficas, socioeconômicas, dietéticas e relacionadas à saúde, com o componente de exame contendo medidas médicas, odontológicas, fisiológicas e exames laboratoriais.
A pesquisa examina uma amostra de cerca de 5.000 pessoas a cada ano, selecionada à partir de amostragem complexa a fim de selecionar uma amostra representativa da população civil não institucionalizada dos EUA. Sendo assim, as análises utilizando este estudo devem ser realizadas utilizando técnicas e ferramentas que levem em conta a amostragem complexa.
Neste desafio, no entanto, iremos assumir que os dados foram obtidos usando uma amostra aleatória da população de interesse e utilizaremos técnicas e ferramentas de análise usuais para amostras aleatórias para fins didáticos.
O Patient Health Questionnaire-9 (PHQ-9) é um instrumento utilizado para avaliar o grau de depressão em pacientes. O questionário consiste de 9 itens em que os respondentes indicam a frequência (0 = “nenhuma vez”, 1 = “menos de uma semana”, 2 = “uma semana ou mais” e 3 = “quase todos os dias”) de sintomas de depressão nas duas últimas semanas.
O PHQ-9 inclui os seguintes itens para a pergunta “Nas últimas 2 semanas, com que frequência você ficou incomodado por algum dos problemas a seguir?” (0 = “nenhuma vez”, 1 = “menos de uma semana”, 2 = “uma semana ou mais” e 3 = “quase todos os dias”):
1 - Pouco interesse ou pouco prazer em fazer as coisas
2 - Se sentiu para baixo, deprimido(a) ou sem perspectiva
3 - Dificuldade para pegar no sono ou permanecer dormindo ou dormiu mais do que o costume
4 - Se sentiu cansado(a) ou com pouca energia
5 - Falta de apetite ou comeu demais
6 - Se sentiu mal consigo mesmo(a) ou achou que é um fracasso ou que decepcionou sua família ou a você mesmo(a)
7 - Dificuldade para se concentrar nas coisas (como ler o jornal ou ver televisão)
8 - Teve lentidão para se movimentar ou falar (a ponto de outras pessoas perceberem), ou ao contrário, esteve tão agitado(a) que você ficava andando de um lado para o outro mais do que costume
9 - Pensou em se ferir de alguma maneira ou que seria melhor estar morto(a)
O escore total é calculado à partir da soma dos itens 1-9 e varia de 0 a 27, em que maiores valores do escore indicam maiores frequências de sintomas de depressão. Aqueles com pontuação maior ou igual a 5 para o escore total de PHQ-9 são considerados como tendo sintomas leves (5-9), moderados (10-14), moderadamente severos (15-19) e severos de depressão (>= 20).
O Healthy Eating Index (HEI) é uma medida de qualidade da dieta baseado nas orientações dietéticas do governo federal americano (Dietary Guidelines for Americans). O HEI utiliza diferentes grupos alimentares para o cálculo do escore, variando de 0 a 100, em que maiores valores do escore refletem dietas mais próximas das orientações alimentares em vigor.
O Physical Activity Guidelines for Americans (PAG) é emitido pelo Departamento de Saúde e Serviços Humanos (U.S. Department of Health and Human Services (HHS)) e possui recomendações de atividades físicas. Este documento é utilizado em conjunto com as orientações dietéticas para americanos (Dietary Guidelines for Americans) para promover a importância de ser fisicamente ativo e seguir uma dieta saudável.
O PAGA recomenda que adultos se engajem em pelo menos 150 minutos de atividades aeróbicas de intensidade moderada ou 75 minutos de atividades aeróbicas de intensidade vigorosa semanalmente. A partir dos dados coletados do NHANES, é possível calcular o número de minutos de atividades físicas, definido como a total minutos semannais de atividades físicas moderadas + 2*(total minutos de atividades aeróbicas vigorosas).
Em base da situação abordada a parti de uma análise inferencial, se entende que não é possível validar a hipótese nula, onde a questão era se as práticas de hábitos saudáveis tinha relação com os casos de depressão.
De forma geral, a conclusão é que não podemos aceita o H0 (Hipótese nula) por não haver evidencias o suficiente para dizer que ter ou não ter hábitos saudáveis tem alguma relação com os nives de depressão. Podemos dizer que a depressão pode afetar pessoas com praticão hábitos saudáveis da mesmo forma que pode afeta pessoas que não praticão hábitos saudáveis.
Em alguns casos o H0, teve p-valor acima de 0,05, abrindo uma possibilidade de investigar ainda mais, porem por conta da falta de mais variáveis para analisar de uma forma mais precisa, o resultado no final chega na mesma conclusão. Essa certeza veio ao se discuti o assunto com uma psicologa, todo o esclarecimento foi essencial para entender a conclusão desse projeto.