On latest version's of JetPack Compose this problem solved. For code sample you may look at https://github.com/JetBrains/compose-jb

build JetPack Compose + Kotlin MPP on Kotlin 1.4.*

Use workaround

Look at lib-compose/build.gradle.kts:

plugins {
    id("com.android.library")
    kotlin("multiplatform")
}
//...
//todo Workaround here:
configurations {
    create("composeCompiler") {
        isCanBeConsumed = false
    }
}
dependencies {
    "composeCompiler"("androidx.compose:compose-compiler:$ANDROID_COMPOSE_VERSION")
}
android {
    afterEvaluate {
        val composeCompilerJar =
            configurations["composeCompiler"]
                .resolve()
                .singleOrNull()
                ?: error("Please add \"androidx.compose:compose-compiler\" (and only that) as a \"composeCompiler\" dependency")
        tasks.withType<org.jetbrains.kotlin.gradle.tasks.KotlinCompile> {
            kotlinOptions.freeCompilerArgs += listOf("-Xuse-ir", "-Xplugin=$composeCompilerJar")
        }
    }
}

Build this sample .apk

./gradlew assembleDebug
temporarily MPP works better on version Android Studio 4.2 Canary-6

Install apk from dir: app/build/outputs/apk/debug/app-debug.apk

Additional info for JetBrains Kotlin Team and Google Android Team:

Sorry for Russian language, later will translate to EN.
Есть известный баг @Composable функции не работают с Kotlin Multiplatform id("org.jetbrains.kotlin.multiplatform")
Баг заведён в JetBrains YouTrack: https://youtrack.jetbrains.com/issue/KT-38694
И в Google IssueTracker: https://issuetracker.google.com/issues/155536223

Ключевой момент что для починки нужно добавить аргумент компилятора "-Xplugin=$composeCompilerJar"
В случае с модулями id("kotlin-android") аргумент -Xplugin уже добавляется
В случае с kotlin("multiplatform") я добавил этот аргумент руками

Как починить багу?
Эта логика описана в репозитории AOSP: https://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:Wl-GOo5My08J:https://android.googlesource.com/platform/frameworks/support/%2B/androidx-master-dev/buildSrc/src/main/kotlin/androidx/build/AndroidXUiPlugin.kt+&cd=1&hl=en&ct=clnk&gl=ru#100
Предположу что где-то там можно решить эту проблему удобным способом.
Обратите внимание что добавление -Xplugin происходит до конфигурации project.configureForMultiplatform()
Возможно стоит изменить порядок кода.
Один из авторов этого кода - Nikolay Igotti. Возможно он сможет помочь с решением этой задачи.

P.S.

Thanks to Google and JetBrains for amazing JetPack Compose and Kotlin Multiplatform.
Together we can make these tools even better.

Thanks to https://github.com/r4zzz4k for help