Skip to content

Commit

Permalink
Update index.md
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
molsim authored Feb 13, 2024
1 parent 50f0638 commit 44543b2
Showing 1 changed file with 1 addition and 1 deletion.
2 changes: 1 addition & 1 deletion index.md
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -105,7 +105,7 @@ The course provides an overview of molecular modeling and simulations methods in
<details><summary><ins>Лекция 2</ins></summary> Форматы хранения информации о структуре молекул (PDB, mmCIF, mol2, Z-матрицы и др.). Формат PDB, поля формата. Происхождение структурной информации, основные экспериментальные методы, представление данных. Элементарная ячейка кристалла, асиметричная единица, понятие BioAssembly, кристаллографическая и некристаллографическая симметрии структур. PDB: B-факторы, occupancy. PDB: специфика ЯМР структур. Правила описания белков, нуклеиновых кислот, липидов, лигандов. Тяжелоатомные и протонированные модели. Протонирование моделей. Базы данных структур. Базы PDB, NDB, MMDB, CCDC, EMDB. Поиск в базах данных, поиск по последовательности и по структуре. Форматы записи электронной плотности. Типичные проблемы в структурах, ротамеры боковых цепей. Определение качества PDB структур. Программы анализа качества структур.


<a href="https://www.dropbox.com/s/lh6w1280fghwxnc/Lecture2.ppt?dl=0">Слайды лекции.</a>
<a href="https://www.dropbox.com/scl/fi/r2aen4dsp57ehpw3xqw5l/Lecture2.ppt?rlkey=hz3l3rhp09ae2w2a2uus9583i&dl=0">Слайды лекции.</a>
</details>
<details><summary><ins>Required reading</ins></summary>
- <a href="https://pdb101.rcsb.org/learn/guide-to-understanding-pdb-data/introduction">Introduction to PDB Data</a>
Expand Down

0 comments on commit 44543b2

Please sign in to comment.