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feat: map any AllgemeinerLeistungszustandTyp to ECOG #181

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feat: map any AllgemeinerLeistungszustandTyp to ECOG #181

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30 changes: 30 additions & 0 deletions src/main/java/org/miracum/streams/ume/obdstofhir/mapper/ObdsToFhirMapper.java
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Expand Up @@ -2,6 +2,7 @@

import ca.uhn.fhir.model.api.TemporalPrecisionEnum;
import com.google.common.hash.Hashing;
import de.basisdatensatz.obds.v3.AllgemeinerLeistungszustandTyp;
import de.basisdatensatz.obds.v3.DatumTagOderMonatGenauTyp;
import de.basisdatensatz.obds.v3.DatumTagOderMonatOderJahrOderNichtGenauTyp;
import java.nio.charset.StandardCharsets;
Expand Down Expand Up @@ -317,4 +318,33 @@ public static Optional<DateTimeType> convertObdsDatumToDateTimeType(
date.setPrecision(TemporalPrecisionEnum.DAY);
return Optional.of(date);
}

/**
* Transforms AllgemeinerLeistungszustandTyp to another AllgemeinerLeistungszustandTyp using ECOG.
*
* @param value The value to be transformed
* @return Returns AllgemeinerLeistungszustandTyp for ECOG or U (unknown)
*/
public static AllgemeinerLeistungszustandTyp allgemeinerLeistungszustandToEcog(
AllgemeinerLeistungszustandTyp value) {
switch (value) {
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_100:
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_90:
return AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_0;
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_80:
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_70:
return AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_1;
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_60:
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_50:
return AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_2;
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_40:
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_30:
return AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3;
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_20:
case AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_10:
return AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_4;
default:
return value;
}
}
}
20 changes: 20 additions & 0 deletions src/main/resources/schema/oBDS_v3.0.3.bindings.xjb
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Expand Up @@ -37,5 +37,25 @@
<jaxb:bindings node="//xs:complexType[@name='SYST_Typ']//xs:element[@name='Ende_Grund']/xs:simpleType">
<jaxb:typesafeEnumClass name="EndeGrund" />
</jaxb:bindings>
<jaxb:bindings node="//xs:simpleType[@name='Allgemeiner_Leistungszustand_Typ']">
<jaxb:typesafeEnumClass name="Allgemeiner_Leistungszustand_Typ">
<jaxb:typesafeEnumMember value="0" name="ECOG_0"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="1" name="ECOG_1"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="2" name="ECOG_2"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="3" name="ECOG_3"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="4" name="ECOG_4"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="U" name="U"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="10%" name="KARNOFSKY_10"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="20%" name="KARNOFSKY_20"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="30%" name="KARNOFSKY_30"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="40%" name="KARNOFSKY_40"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="50%" name="KARNOFSKY_50"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="60%" name="KARNOFSKY_60"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="70%" name="KARNOFSKY_70"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="80%" name="KARNOFSKY_80"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="90%" name="KARNOFSKY_90"/>
<jaxb:typesafeEnumMember value="100%" name="KARNOFSKY_100"/>
</jaxb:typesafeEnumClass>
</jaxb:bindings>
</jaxb:bindings>
</jaxb:bindings>
41 changes: 41 additions & 0 deletions src/test/java/org/miracum/streams/ume/obdstofhir/mapper/ObdsToFhirMapperTests.java
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Expand Up @@ -3,6 +3,7 @@
import static org.assertj.core.api.Assertions.assertThat;
import static org.junit.jupiter.api.Assertions.assertThrows;

import de.basisdatensatz.obds.v3.AllgemeinerLeistungszustandTyp;
import de.basisdatensatz.obds.v3.DatumTagOderMonatGenauTyp;
import de.basisdatensatz.obds.v3.DatumTagOderMonatGenauTyp.DatumsgenauigkeitTagOderMonatGenau;
import de.basisdatensatz.obds.v3.DatumTagOderMonatOderJahrOderNichtGenauTyp;
Expand Down Expand Up @@ -224,4 +225,44 @@ void shouldConvertDatumTagOderMonatOderJahrOderNichtGenauTypToDateType(

assertThat(actual.asStringValue()).isEqualTo(expected);
}

@ParameterizedTest
@MethodSource("allgemeinerLeistungszustandTestData")
void shouldMapAllegemeinerLeistungszustandToEcog(
AllgemeinerLeistungszustandTyp in, AllgemeinerLeistungszustandTyp expected) {
var actual = ObdsConditionMapper.allgemeinerLeistungszustandToEcog(in);
assertThat(actual).isEqualTo(expected);
}

static Stream<Arguments> allgemeinerLeistungszustandTestData() {
return Stream.of(
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_100, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_0),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_90, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_0),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_80, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_1),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_70, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_1),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_60, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_2),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_50, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_2),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_40, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_30, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_20, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_4),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_10, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_4),
Arguments.of(
AllgemeinerLeistungszustandTyp.KARNOFSKY_40, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.U, AllgemeinerLeistungszustandTyp.U),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_0, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_0),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_1, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_1),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_2, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_2),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_3),
Arguments.of(AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_4, AllgemeinerLeistungszustandTyp.ECOG_4));
}
}
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